R包說(shuō)明書(shū)的獲取

1百度/谷歌XX小抄
2https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/（慢）
3生信星球公眾號(hào)

R包示例：tidyr

（1）數(shù)據(jù)框的變形
（2）處理數(shù)據(jù)框中的空值
（3）根據(jù)一個(gè)表格衍生出其他表格
（4）實(shí)現(xiàn)行或列的分割和合并
把數(shù)據(jù)處理成標(biāo)準(zhǔn)而統(tǒng)一的數(shù)據(jù)框（Tidy Data),才能進(jìn)行進(jìn)一步的數(shù)據(jù)處理和作圖

學(xué)會(huì)安裝極簡(jiǎn)R包

1library(tidyr)#如果沒(méi)有這個(gè)包，就會(huì)報(bào)錯(cuò)
2install.packages("tidyr")#下載和安裝tydir,默認(rèn)安裝到你的工作目錄里

數(shù)據(jù)框的基礎(chǔ)知識(shí)示例

1.新建數(shù)據(jù)框(這里直接把新建的數(shù)據(jù)框賦值給了a)
a<-data.frame(GeneId = rep("gene5",times=3),SampleName =paste("Sample",1:3,sep=""),Expression=c(14,19,18))

tidyr作用

1.Reshape Data
gather合并列
spread分散列名
2.Handle Missing Values
drop_na()#有空值的，整行刪除掉
fill()#根據(jù)上一行的數(shù)值填充上
replace_na()#空值填進(jìn)去特定的一個(gè)數(shù)值,括號(hào)里填數(shù)據(jù)框名，要填的列名=要填的值
3Expand Tables
complete()#把空值的位置補(bǔ)全
expand()#列出每列值盡可能的組合