新浙江大學(xué)時期

1998年9月15日，鑒于蘇聯(lián)高等教育模式的弊端越來越明顯，以及國家對建設(shè)世界一流大學(xué)的需要，經(jīng)國務(wù)院批復(fù)，曾經(jīng)從浙江大學(xué)分離出去的杭州大學(xué)、浙江農(nóng)業(yè)大學(xué)、浙江醫(yī)科大學(xué)回歸浙大母體，共同組建了新的浙江大學(xué)。至此，自1952年院系調(diào)整以來所形成的四校分治的局面結(jié)束了。浙江大學(xué)由此停止了對蘇聯(lián)模式的使用，恢復(fù)了1952年之前的學(xué)科設(shè)置，重新成為了綜合性大學(xué)，再次走上了快速發(fā)展的道路，并邁上了建設(shè)世界一流大學(xué)的新征程。由此，浙江大學(xué)迎來了浙大百年發(fā)展史上的第三個黃金時期，邁出了復(fù)興的第二步。

浙江大學(xué)

1999年，浙江大學(xué)成為首批9所列入國家“985工程”建設(shè)計劃的全國重點大學(xué)之一。

2007年1月21日，浙江大學(xué)恢復(fù)了1952年院系調(diào)整時停辦的航空航天系，該系隸屬于新成立的航空航天學(xué)院。

2009年上半年，浙江大學(xué)實行了學(xué)部制，全校調(diào)整為七大學(xué)部——人文學(xué)部、社會科學(xué)學(xué)部、理學(xué)部、工學(xué)部、信息學(xué)部、農(nóng)業(yè)生命環(huán)境學(xué)部、醫(yī)藥學(xué)部。

2009年10月9日，中國的九校聯(lián)盟（C9）啟動，浙江大學(xué)成為聯(lián)盟成員之一。