Barcode file missing. Expecting barcodes.tsv.gz

常見錯誤:

說找不到Barcode文件,但明明存在Barcode:

Error in Read10X() : Barcode file missing
那很有可能是因為三個10X數(shù)據(jù)的命名出了問題,一定要命名成
"barcodes.tsv"
"genes.tsv"
"matrix.mtx"
【補充:cellranger的V2版本得到的結(jié)果分別是:
barcodes.tsv、
genes.tsv、
matrix.mtx;
V3版本得到的結(jié)果分別是:
matrix.mtx.gz、
features.tsv.gz、barcodes.tsv.gz】

說找不到基因文件,那么就要看看測序數(shù)據(jù)是不是解壓后的

Error in Read10X() : Gene name or features file missing

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