常見錯誤:
說找不到Barcode文件,但明明存在Barcode:
Error in Read10X() : Barcode file missing
那很有可能是因為三個10X數(shù)據(jù)的命名出了問題,一定要命名成
"barcodes.tsv"
"genes.tsv"
"matrix.mtx"
【補充:cellranger的V2版本得到的結(jié)果分別是:
barcodes.tsv、
genes.tsv、
matrix.mtx;
V3版本得到的結(jié)果分別是:
matrix.mtx.gz、
features.tsv.gz、barcodes.tsv.gz】
說找不到基因文件,那么就要看看測序數(shù)據(jù)是不是解壓后的
Error in Read10X() : Gene name or features file missing