linux 安裝R包，報錯ggforce.rdb is corrupt

在linux 服務(wù)器上安裝R ?分析包，總會遇見很多錯誤！在windows下安裝通常會比較順利！總結(jié)了一套通過window 安裝linux R 分析包的經(jīng)驗(yàn)，共享給大家。

比如安裝R 的?clusterProfiler 分析包，使用命令BiocManager::install("clusterProfiler"）報錯信息如下：

ERROR: compilation failed for package ‘systemfonts’

ERROR: dependency ‘systemfonts’ is not available for package ‘ggforce’

ERROR: dependency ‘ggforce’ is not available for package ‘ggraph’

ERROR: dependency ‘ggforce’ is not available for package ‘scatterpie’

ERROR: dependencies ‘ggraph’, ‘scatterpie’ are not available for package ‘enrichplot’

可以在window安裝同一版本的R軟件，安裝好clusterProfiler后，找到包的安裝路徑，把依賴的包直接拷貝到linux lib目錄下：

舉例：

window:D:/software/R-4.2.0/library

拷貝到linux 服務(wù)器：/usr/anaconda/envs/R.4.2.0/lib/R/library

進(jìn)入linux 服務(wù)器：

library（clusterProfiler）

如果報錯,可以單獨(dú)安裝缺少或者損壞的包

如我遇到的錯誤：

shared object ‘ggraph.so’ not found

解決方法：

BiocManager::install("ggraph",force=TRUE)

ggforce.rdb is corrupt

解決方法：

重啟R

再進(jìn)入就可以了


?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成，瀏覽時請結(jié)合常識與多方信息審慎甄別。
平臺聲明：文章內(nèi)容（如有圖片或視頻亦包括在內(nèi)）由作者上傳并發(fā)布，文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn)，簡書系信息發(fā)布平臺，僅提供信息存儲服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容