根據(jù)IQR過(guò)濾基因


例如:用作探針表達(dá)數(shù)據(jù)的初步過(guò)濾

為什么要初步過(guò)濾?


具體使用:
https://www.rdocumentation.org/packages/genefilter/versions/1.54.2/topics/nsFilter

IQR是什么?
三四分位數(shù)減去第一四分位數(shù)

函數(shù)的理解
1、var.func設(shè)置為IQR
2、每個(gè)probe在所有樣本中可以用IQR方法算出一個(gè)值X
3、當(dāng)filterByQuantile為T(mén)rue的時(shí)候,var.cutoff的值為所有X的quantile值,比如為0.5為二四分位,對(duì)于那些X小于(所有X的二四分位值)的探針將被過(guò)濾
4、當(dāng)filterByQuantile為False的時(shí)候,var.cutoff的值為absolute value,也就是一個(gè)單純X過(guò)濾閾值,對(duì)于那些X小于這個(gè)過(guò)濾閾值的探針將被過(guò)濾

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