日常工作環(huán)境的好壞直接影響我們的心情和效率，這篇文章介紹一下我這些年用得順手的一些工具。

1.本地電腦

平臺： Mac 電腦，強烈建議搞生信用 Mac air 或 Mac Pro

終端： iTerm2，比系統(tǒng)自帶的好用太多

編輯器：

• 寫代碼：Visual Studio Code或Sublime Text
• 寫 Markdown 文檔：Typora
• R 畫圖：當然是Rstudio了
• 工作日記：印象筆記，工作日志在一處記錄，所有平臺都能同步（電腦，手機，平板）

2.服務器

操作系統(tǒng)： Ubuntu 首選，其次 Centos，因為 Centos 為了追求穩(wěn)定，內(nèi)核往往比較舊，有時候一些軟件會安裝不上，非常麻煩。

Shell： Bash，建議安裝bash-it 主題

編輯器： vim，編輯器之神， 一般 Linux 系統(tǒng)都自帶，這也是用它的好處之一，無需安裝，學會這一個，在任務服務器上都能編輯文本文件（這也是我們打交道最多的一種文件格式，不管是Shell, Python, Perl或R腳本，還是Fasta/Fastq格式的序列文件，本質(zhì)上都是文本文件）

生信軟件安裝： 先安裝Anaconda，然后添加 bioconda 源來實現(xiàn)安裝生信軟件的目的,文末附有我的 Anaconda 配置文件.condarc，添加了清華大學的鏡像。

查看后臺任務： htop，由于經(jīng)常要看后臺的任務沒有沒跑完，htop比系統(tǒng)自帶的 top 命令好用

代碼管理： GitHub，生信人平時會寫很多腳本，這些腳本在未來某一天可能會再次用到，因此養(yǎng)成良好的備份代碼的習慣非常重要，這樣日積月累，自己的套路就會越積越多。

以上，就是我的工作環(huán)境，供大家參考。

附：

Anaconda配置文件.condarc文件（位于用戶家目錄~下）：

channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
  - bioconda
  - r
  - defaults
  - conda-forge
show_channel_urls: true
ssl_verify: false