GEO數據集基因名轉換LncRNA

GSE99416??GSE51308??GSE50710??GSE33335?GSE50710

GPL16956?GPL15314?GPL13825?GPL5175?GPL13825

做了三天,終于把這三個GEO數據集探針名對應基因名symbol。

嘗試各類方法:

1.基因樹的方法,洋洋灑灑幾千字,但是下載R包,就無法正常安裝。

2.NCBI及ENSEMBLE文件比對,無疾而終,不是代碼有錯誤,就是需要特殊PERL文件。

3.FASTa序列入手,比對基因序列,成功將探針轉化為Symbol!此處應該有掌聲。

有部分數據集 依然無法轉換,不過大家可以探討,聯系309739995

最后編輯于
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯系作者
【社區(qū)內容提示】社區(qū)部分內容疑似由AI輔助生成,瀏覽時請結合常識與多方信息審慎甄別。
平臺聲明:文章內容(如有圖片或視頻亦包括在內)由作者上傳并發(fā)布,文章內容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發(fā)布平臺,僅提供信息存儲服務。

相關閱讀更多精彩內容

友情鏈接更多精彩內容