R包學習-dplyr
生信星球Day6-R包.png
一、安裝和加載R包
1.鏡像設(shè)置：
2.安裝：
CRAN：install.packages(“包”) 或者 Biocductor: BiocManager::install(“包”)
3. 加載：
library(包) 或 require(包)
#示例：
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
install.packages("dplyr")
library(dplyr)
二、dplyr五個基礎(chǔ)函數(shù)
（以下示例數(shù)據(jù)皆為 內(nèi)置數(shù)據(jù)集iris的簡化版: test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] ）
原始狀態(tài)
1. 新增列 :mutate()
新增列
2. 按列篩選 ：select()
2.1 按列號篩選
按列號
2.2 按列名篩選
按列名篩選.png
差別在這里：
選擇 字符向量 中的列，select中不能直接使用字符向量篩選，需要使用
one_of函數(shù)
3. 篩選行：filter()
按行篩選
4. 按某1列或某幾列對整個表格進行排序: arrange()
排列.png
5.匯總/計算：summarise()
*結(jié)合group_by使用實用性強
匯總.png
三、dplyr兩個實用技能
1. 管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
一次性完成了上面的步驟
%>%管道操作符，運用起來特別方便，能夠連接前后兩個步驟，實現(xiàn)嵌套使用簡化代碼的同時還能避免存儲多余的中間值而節(jié)省內(nèi)存空間。它的作用是把符號左側(cè)返回的結(jié)果，作為符號右側(cè)調(diào)用函數(shù)的第1個參數(shù)。
- 加載任意一個tidyverse包即可用管道符號
Tidyverse包是一個數(shù)據(jù)科學套件，讓數(shù)據(jù)工作流變得更加簡單和高效。包括：
- dplyr包：用于數(shù)據(jù)操作和處理，常用的函數(shù)filter(), select(), mutate(), arrange(), group_by()， summarise()等，非常高效地完成數(shù)據(jù)選擇、排序、聚合。
- ggplot2包：用于數(shù)據(jù)可視化。
- tidyr包：用于數(shù)據(jù)的整潔。pivot_longer()函數(shù)把數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為長數(shù)據(jù)；pivot_wider()函數(shù)把數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為寬數(shù)據(jù)。
- readr包：用于數(shù)據(jù)的讀取。
- forcats包：用于因子類型的管理。
- purrr包：用于函數(shù)式編程
2. count統(tǒng)計某列的unique值
四、dplyr處理關(guān)系數(shù)據(jù)
(以下示例數(shù)據(jù)設(shè)置)
數(shù)據(jù)設(shè)置
1. 內(nèi)連inner_join:取交集
內(nèi)連
2. 左連left_join
左連
3. 全連full_join
全連
4. 半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄semi_join
半連接
5. 反連接：返回無法與y表匹配的x表的所記錄anti_join
反連接.png
6. 簡單合并
數(shù)據(jù)準備.png
簡單連接.png
以上
From 生信星球?qū)W習小組第130期
參考:
