1##一代測(cè)序
sanger測(cè)序,雙脫氧核苷酸ddNTP會(huì)結(jié)合所有位點(diǎn),
設(shè)置四個(gè)反應(yīng)體系1-4,分別加入引物、DNA聚合酶、四種dNTP、一定比例的ddNTP(帶有放射性標(biāo)記)ddATP遇到了T位點(diǎn),就結(jié)合并終止
準(zhǔn)確性高達(dá)99.999%
2##二代測(cè)序
第二代DNA測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing,NGS )-循環(huán)陣列合成測(cè)序法。
主要特點(diǎn)高通量
Roche公司的454技術(shù)、illumina公司的Solexa/Hiseq技術(shù)和ABI公司的SOLID技術(shù)標(biāo)志第二代測(cè)序技術(shù)誕生
Illumina:Hiseq(Pair End雙端)
flowcell: 測(cè)序反應(yīng)的載體/容器,1個(gè)flowcell有8個(gè)lane
lane: 測(cè)序反應(yīng)的平行泳道,試劑添加、洗脫等過(guò)程的發(fā)生位置
雙端測(cè)序: 可能序列比較長(zhǎng)有四五百bp,兩邊各測(cè)120-150bp
flowcell構(gòu)造:一個(gè)lane包含兩列(swath),每一列有60個(gè)tile,每個(gè)tile會(huì)種下不同的cluster,每個(gè)tile在一次循環(huán)中會(huì)拍照4次(每個(gè)堿基一次)
第一步: 構(gòu)建DNA文庫(kù)
第二步: 上樣 【重點(diǎn)搞清楚lane上有哪兩種接頭,待測(cè)序列含有哪兩種接頭,這很重要!】
第三步:橋式PCR
第四步:測(cè)序
3##三代測(cè)序
第三代測(cè)序技術(shù)以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的納米孔單分子測(cè)序技術(shù)為標(biāo)志,不需要經(jīng)過(guò)PCR擴(kuò)增,超長(zhǎng)讀長(zhǎng),可達(dá)二代測(cè)序的100倍以上,實(shí)現(xiàn)了對(duì)每一條DNA分子的單獨(dú)測(cè)序。錯(cuò)誤率比二代要高,達(dá)到10-15%。