「生物信息」概念被提出已有許多年，可以說(shuō)比我年齡大了許多。但到底是什么，不同人有不同定義。尤其自高通量測(cè)序出現(xiàn)，對(duì)于生物信息來(lái)說(shuō)，有一大波變化。而我時(shí)常與相似背景的朋友提及，我們其實(shí)都是吃了這一波紅利。不然也保不齊現(xiàn)在如何，當(dāng)然以我們的努力程度，做其他估計(jì)也不會(huì)很差。
總的來(lái)說(shuō)，我個(gè)人覺(jué)得搞「生物軟件」或者「生信軟件」開(kāi)發(fā)或許也可以算生物信息的范疇。但至于科班的定義，就不太清楚了。從做生物學(xué)問(wèn)題挖掘的角度來(lái)說(shuō)，我們肯定是需要一些好用的「生物軟件」。諸如現(xiàn)在各式各樣的變異檢測(cè)，比較基因組云云，如何更好地探索數(shù)據(jù)，是一個(gè)問(wèn)題。
我們需要好用的工具，但是沒(méi)有人開(kāi)發(fā)出來(lái)過(guò)；我們有許多想要的功能，許多想法，但是我們不可能抽出時(shí)間開(kāi)發(fā)，因?yàn)槲覀兪亲錾飳W(xué)問(wèn)題挖掘的，做生物信息學(xué)在生物學(xué)研究上的應(yīng)用的，分析好當(dāng)前的數(shù)據(jù)就足夠了，開(kāi)發(fā)一款軟件往往顯得本末倒置。絕大多數(shù)人與我們一樣，所以這是一個(gè)死鎖。
絕大多數(shù)人都需要，但是絕大多數(shù)人都不會(huì)去做，也不愿意去做，甚至不可能去做。因?yàn)椋@也是一個(gè)事實(shí)，我們還有更重要的事情去做。
從單一項(xiàng)目的角度來(lái)說(shuō)，沒(méi)有錯(cuò)，因?yàn)轫?xiàng)目只有3~5年；從個(gè)人事業(yè)的角度來(lái)說(shuō)，也沒(méi)有錯(cuò)，因?yàn)楹芸赡苘浖_(kāi)發(fā)出來(lái)，人生的一個(gè)階段也就結(jié)束了；但是從整體科研工作人員需要來(lái)說(shuō)，又是否值得？
我們有很多更重要的事情要做，哪個(gè)更重要，如何去平衡，如何去權(quán)衡。這是一個(gè)問(wèn)題。
有些人可能會(huì)問(wèn)，為什么就不可能找人合作，你們完全可以交叉學(xué)科。但這么問(wèn)的朋友往往沒(méi)有交叉過(guò)。很多時(shí)候，不同領(lǐng)域的人，理念難以統(tǒng)一，看問(wèn)題的角度不一樣，好時(shí)是1+1>2，不好時(shí)是1+1<1?！干镘浖剐枰錾锏娜藖?lái)開(kāi)發(fā)，因?yàn)樽錾锏娜瞬拍苷嬲斫庾錾锏娜讼胍裁?，期望怎么用。?dāng)然，我并不是反對(duì)交叉，反而我支持交叉，只是如何交叉，是一個(gè)問(wèn)題。尤其在，是生物主導(dǎo)開(kāi)發(fā)為輔，還是兩者并重，或者生物為輔開(kāi)發(fā)為主？這個(gè)難以定奪。再換個(gè)角度來(lái)看，從專(zhuān)業(yè)和領(lǐng)域的熱度來(lái)說(shuō)，從項(xiàng)目的資助角度來(lái)說(shuō)，生物主導(dǎo)開(kāi)發(fā)為輔？可能性低，因?yàn)殚_(kāi)發(fā)往往有更高的熱度拿到更好的項(xiàng)目。甚至，其實(shí)并不需要拿項(xiàng)目，做開(kāi)發(fā)的常常是工程化思想，考慮的是純粹應(yīng)用可能性和產(chǎn)品轉(zhuǎn)化效率。這個(gè)本身跟做生物軟件開(kāi)發(fā)的出發(fā)點(diǎn)不同，終點(diǎn)也不同。于是問(wèn)題就會(huì)出現(xiàn)。所以還是要做生物的人自己來(lái)開(kāi)發(fā)生物軟件。而做生物的哪里有時(shí)間去折騰這些？除了一些奇葩的人喜歡做旁門(mén)左道不是？
回到主題，
最后，「生物軟件開(kāi)發(fā)」是的，就是一把死鎖。很多人都需要一些好用的軟件，但是沒(méi)有人愿意去做這些軟件。在未來(lái)很長(zhǎng)一段時(shí)間，大伙繼續(xù)用斧頭砍樹(shù)，很難出現(xiàn)電鋸，因?yàn)闆](méi)有人愿意開(kāi)發(fā)，我們也不愿意，我們還有更重要的事情要去做。那怎么辦？自然是等，等，等，等到有一天，搞開(kāi)發(fā)的人發(fā)現(xiàn)，我把馬達(dá)做好了，加上鋸齒片，是不是就可以拿來(lái)“砍樹(shù)”？但是，這個(gè)是多久以后的事情？誰(shuí)知道呢。領(lǐng)域往前走，硬件很重要，軟件也很重要。最后，是自己開(kāi)了這把鎖，還是別人來(lái)鋸開(kāi)？
PS：我還是要補(bǔ)充一下，總有一些人在試圖自己開(kāi)鎖，與大伙共勉！