封面

寫在前面

前面已經(jīng)說了，接下來要絕對地減少在寫工具上耗費(fèi)的時(shí)間。主要原因有二：

1. 我慢慢覺得現(xiàn)在每次寫完之后，只有無盡空虛，感覺并沒有意義，或者似乎并不值得我去耗費(fèi)時(shí)間在上面
2. 三五位長者建議我將時(shí)間和精力盡可能全部放在分析和生物學(xué)問題上，這也是我目前在做的事情。
   所以，最近我確實(shí)并沒有寫代碼。盡可能堅(jiān)持一周不浪費(fèi)累計(jì)一天的工作時(shí)間在工具實(shí)現(xiàn)上。

實(shí)踐過程

過去的這一周，課題組朋友與我一起提取了一批樣品的RNA，提取本身并不麻煩。難的在于我們的樣品量極其小。（不知為何，每一步要想偷懶的，最后還是得重做一次....多跑了兩三次電泳....也確定了，RNA點(diǎn)到瓊脂糖凝膠電泳里，確實(shí)還是要加loading buffer....）。
所以過去的一周，我并沒有做多少實(shí)驗(yàn)，不過，總是會不經(jīng)意閃過一些從前碼碼時(shí)想解決但是卻沒解決的問題。
等待離心，等待沉淀的時(shí)候，這些沒有解決的問題一個(gè)一個(gè)地閃過，當(dāng)然不能解決的，往往還是解決不了。運(yùn)氣好了，確實(shí)也能解決一些很小的問題。

最終結(jié)果

終于，在第一階段的實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后，我大體想到了一個(gè)解決早先Map Gene On Genome 工具的文本layout問題的代碼邏輯，大體實(shí)現(xiàn)如下：

尚未實(shí)現(xiàn)控制界面時(shí)的狀態(tài)

初始化的狀態(tài)

稍微調(diào)整之后的狀態(tài)

新的繪圖引擎支持下，按心情調(diào)整之后的狀態(tài)

3. 一個(gè)兩列的 基因配對信息，格式為：基因ID_1 基因ID_2
4. 一個(gè)兩列的 基因標(biāo)簽著色信息

整體的初始數(shù)據(jù)輸入?yún)?shù)

附帶成果

其實(shí)在整實(shí)驗(yàn)的第一天結(jié)束后，還實(shí)現(xiàn)了另一個(gè)工具，CircleGeneViewer，這里只上一個(gè)圖

展示一些基因?qū)Φ男畔?/div>

輸入的參數(shù)界面

寫在最后

可能，有些東西確實(shí)需要時(shí)間的沉淀，也不能太著急。
我還是記得前兩三年寫一些中文文稿時(shí)，碩導(dǎo)教導(dǎo)了我科技論文有別于我現(xiàn)在寫的這個(gè)博文的地方。
也有這兩天正好要整一個(gè)摘要投到八月成都的植物基因組大會的時(shí)候，博導(dǎo)在外文上的措辭確實(shí)不是我目前所可能在近期內(nèi)達(dá)到的。
我專門問了是否有什么方式可能快速提升，而答案是沒有的。

問答過程...

所以，還是寫代碼簡單，其實(shí)快速提升的方式，我跟不少人提過了，如果只是達(dá)到我現(xiàn)在這種狀態(tài)，那么你需要做的 只是絕對地獨(dú)立地完成一個(gè)完整的項(xiàng)目 而 不借助于其他人，結(jié)果就是 質(zhì)的飛躍。
然而，寫文章，似乎完全不同。沒有突飛猛進(jìn)的方法，那就很尷尬了。