使用seqtk來(lái)分割混合的fastq序列

前幾天從SRA數(shù)據(jù)庫(kù)下載的.sra數(shù)據(jù)在解壓的時(shí)候沒(méi)有使用

fastq-dump?--split-files DRR**來(lái)分割兩個(gè)文件,而是直接生成了一個(gè)fastq文件

然而我使用trimming來(lái)過(guò)濾的時(shí)候,用PE命令卻需要輸入兩個(gè)文件。

本想再去重新下載數(shù)據(jù)(很麻煩),但是好友samual推薦了一款軟件seqtk可以用來(lái)分割混合的fastq文件

我試了試,果然可以

安裝命令:

git clone https://github.com/lh3/seqtk.git;cdseqtk;

cd?seqtk;?

make

然后就可以用了.但是需要./seqtk才能使用seqtk這個(gè)軟件。

命令如下:

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