iGenomes的gtf有些不對或者過時

iGenomes (illumina.com)

在做小鼠的轉(zhuǎn)錄本的定量的時候發(fā)現(xiàn)有個基因在NCBI上有四個轉(zhuǎn)錄本，但是發(fā)現(xiàn)自己定量出來卻只有兩個，搞了半天才發(fā)現(xiàn)自己從iGnomes上下載的基因組文件中的gtf真的只有兩個轉(zhuǎn)錄本，這說明iGnomes的版本是有些滯后的

所以如果做轉(zhuǎn)錄本的話偷懶可能是不行的，還是要自己下載比較新的基因組和GTF，然后構(gòu)建index

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