使用Aspera上傳測(cè)序原始數(shù)據(jù)到NCBI

快速上傳較大的文件

1. Aspera下載安裝

下載地址:https://downloads.asperasoft.com/connect2/

網(wǎng)站的下載按鈕將默認(rèn)匹配檢測(cè)到的計(jì)算機(jī)操作系統(tǒng)。

根據(jù)安裝向?qū)О惭b完成之后。

2. 設(shè)置壞境變量

我的電腦 → 鼠標(biāo)右鍵 → 屬性 → 高級(jí)系統(tǒng)設(shè)置 → 環(huán)境變量 → 新建 → 變量名:ASPERA_SCP_PASS,值:路徑/aspera.openssh → 確定

3.根據(jù)提示,下載key file

保存在一個(gè)容易記住的位置。我是直接保存在原始數(shù)據(jù)的文件夾里面。

4. 命令行

Windows + R→? 輸入cmd → 確定 → 打開命令提示符

輸入命令

# 打開對(duì)應(yīng)目錄下的ascp,連接key file,上傳參數(shù),數(shù)據(jù)存放的目錄,郵箱

例如: “C:\Users\Song70\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp.exe" -i “I:\PacBio\aspera.openssh" -QT -l100m -k1 -d “I:\PacBio” subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/自己的NCBI郵箱名稱_0hotXahs

5.運(yùn)行后,上傳速度特別快

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

友情鏈接更多精彩內(nèi)容