總結昨天膠回收失敗的一天,想好點樣的順序,開始實驗之前一定要仔細研究膠回收試劑盒說明書,準備好試驗過程中要用到的東西,做到心中有數(shù)。停止懷疑自己是實驗成功的關鍵。
Steps:
⒈按單酶切體系點樣(用PCR管),用槍吸打混勻,短暫離心將反應液收集至管底,于37℃水浴2h;
⒉用高保真酶擴增目的基因的上臂UP,點好樣,用槍吸打混勻,短暫離心數(shù)秒,跑PCR;


⒊制膠:
80mL1%瓊脂糖凝膠電泳(0.8g Agarose+80mLTAE電泳緩沖液→Goldview Ⅱ型核酸染料)-- 用1.5mm和2mm梳子;
⒋點樣:
6×DNA Loading Buffer,20μL體系6×DNA Loading Buffer加4μL;
⒌Trans2K? DNA Marker和 5kMarker點5μL
⒍記好自己的點樣順序
⒎凝膠成像系統(tǒng)拍照(Image Lab Software)
點擊打開Image Lab → 點擊新建實驗協(xié)議 → 點擊選擇凝膠類型(核酸凝膠-Ethidium Bromide)→ 點擊放置凝膠 → 打開凝膠放置槽放入凝膠 → 點擊運行實驗協(xié)議 → 濾光片位置選擇自動默認 → 確認后開始檢測,彈出圖片 → 在分析工具箱選擇需要調(diào)整的項目 → 在文件欄目下選擇導出--導出以便發(fā)布 → 點擊導出(600dpi) → 選擇保存類型JPJ →保存后關閉軟件及凝膠成像儀
⒏切膠--切膠器(TRANS UV)
利用全式金膠回收試劑盒(EasyPure Quick Gel Extraction Kit)(離心柱吸附)


原理:
利用異硫氰酸胍法溶膠,利用硅膠膜離心柱特異地吸附DNA,適用于從TAE或TBE瓊脂糖凝膠中回收DNA片段,操作簡單快速。純化得到的DNA可用于酶切、連接、克隆、測序等多種操作。
Prepare:
使用前加不同體積無水乙醇到WB中;
開始試驗前打開55℃水浴鍋,ddH2O于65℃水浴鍋預熱;
加異丙醇(為增加DNA回收量,按1:1比例,即凝膠重為100mg,加入100μL異丙醇)
所有離心均在室溫下進行。
操作步驟:
切膠(用切膠器,速度要快)→ 稱重 → 加3倍體積的GSB溶液→ 于55℃水浴溶膠10min → 槍轉移至離心柱中靜置1min →10,000×g離心1min,棄流出液 → 加650μL溶液WB,10,000 ×g離心1min,棄流出液 → 空甩1-2min,去除殘留的WB → 將離心柱置于一干凈的離心管中,開蓋靜置1min → 在柱的中央加入40μL預熱的ddH2O → 室溫靜置1min → 10,000×g離心1min洗脫DNA兩次 → 將洗脫出的DNA于-20℃保存 → 吸取5μL測濃度
注意事項:
⑴ 為了保證回收效果,電泳時使用新鮮電泳緩沖液。
⑵ 切膠時,膠塊盡量?。蝗苣z時,確保膠塊完全融化。
⑶ 為避免紫外照射對DNA造成損傷,影響下游的實驗(如克隆,連接),紫外照射時間盡量短。
Mini point:超微量分光光度計(dsDNA濃度測定)
1μLddH2O Blank校正
DNA純度:OD260/OD280=1.8-2.0

