“做cox比例分析和KM曲線結合分析，閾值該怎么選取，數(shù)據(jù)是否需要標準化等等問題的解決方法”
01—研究背景
對基因功能富集結果的展示有很多種展示方法，有人說氣泡圖展示富集結果不好看，畢竟什么都要看顏值的。而且氣泡圖展示的信息有限，僅展示一些通路的基本信息，無法顯示通路與基因的關系。為了滿足審美觀，開發(fā)了一個小工具——富集分析圈圖。繪制出來的圖不但能顯示感興趣的基因與通路的關系，關鍵繪制出來的圖形顏值高。
網(wǎng)址導航
http://sangerbox.com/Tool 點擊“富集分析圈圖快速繪制工具”
02—使用方法
1.輸入數(shù)據(jù)
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富集分析結果：一共四列，第一列為富集分析term名稱，第一列為這個term包含的基因個數(shù)，第三列為P值或FDR，第四列為term中包含的基因列表，基因與基因之間一“/”隔開，如下圖所示。
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差異基因分析結果：這里去Foldchage最大的前50個基因，取出的基因與做富集時用的基因要一致。注意：這里不一定需要Fold chage，只需要一列是基因，一列對應的有意義的數(shù)字即可，如下圖所示。
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2.設置參數(shù)
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3.展示結果
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