WildCARD_data數(shù)據(jù)預(yù)處理時(shí)報(bào)錯(cuò)：'utf-8' codec can't decode byte 0x8b in position 1

在使用CARD數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)，針對(duì)宏基因組數(shù)據(jù)，需要另外下載WildCARD_data，下載完成后需對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理，才可以使用。
在進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理時(shí)，出現(xiàn)了報(bào)錯(cuò)信息：
UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0x8b in position 1: invalid start byte

wget -O wildcard_data.tar.bz2 https://card.mcmaster.ca/latest/variants
mkdir -p wildcard
tar -xvf wildcard_data.tar.bz2 -C wildcard
rgi wildcard_annotation -i wildcard --card_json ./card.json -v 3.0.8 > wildcard_annotation.log 2>&1
- 出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)，報(bào)錯(cuò)信息如下：
ERROR: UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0x8b in position 1:
invalid start byte in codecs.py line 322
- 查閱資料，發(fā)現(xiàn)是字符編碼的問題，0x8b說明是gzip壓縮過的數(shù)據(jù)
- 進(jìn)入wildcard文件夾，里面的fasta數(shù)據(jù)都是壓縮形式的:card-genomes.txt.gz
- 解決方法：
cd wildcard
gunzip *.gz 
rgi wildcard_annotation -i wildcard --card_json ./card.json -v 3.0.8 > wildcard_annotation.log 2>&1
- WELL DONE
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