學習小組D7筆記-年糕

今天主要是思維導圖


D7-測序基礎(chǔ)知識.png

推薦網(wǎng)站：

原理部分：

  1. 測序的世界 由生信星球編寫，非常詳細地介紹了測序的原理，并且在后半部分有l(wèi)inux處理測序數(shù)據(jù)的教學；強推??！一定要看??！
  2. 【陳巍學基因】視頻1：Illumina測序化學原理
  3. 測序技術(shù)原理及常用數(shù)據(jù)格式簡介 由美格基因編寫，重點看常用數(shù)據(jù)格式部分
  4. 測序發(fā)展史：150年的風雨歷程 由生信寶典編寫，據(jù)說是花花看過寫的最好的測序史

實用網(wǎng)站及工具

  1. FASTX-Toolkit http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/
  • 一款用于處理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序，里面包含了豐富的Fasta/Fastq文件格式轉(zhuǎn)換、統(tǒng)計等命令。

  1. EMBL → Fasta格式轉(zhuǎn)換（在線工具）：
    http://www.geneinfinity.org/sms/sms_embltofasta.html

  2. 常見測序文件格式解析的網(wǎng)站：
    https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format1

  • 該網(wǎng)站包含了各種各樣的測序文件格式說明，想了解文件格式各行各列的含義直接找它即可
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