數(shù)據(jù)類型
向量
1.標(biāo)量和向量的區(qū)分
首先明確“元素”的意思，元素指的是數(shù)字或者字符串（用chr表示）等，根據(jù)它可以區(qū)分兩個詞：
標(biāo)量：一個元素組成的變量，可以是一個數(shù)字也可以是一個字符串，字符串在使用時必須要加引號"ywen"
向量：多個元素組成的變量，c(1,2,3) 依次排列的三個數(shù)字，c("haohao","xuexi","ywen") 依次排列的三個字符串。
使用時，一般都會直接給變量定義，也就是“賦值”，賦予這個變量一個數(shù)值/字符串/數(shù)據(jù)框等等）。
x<- c(1,2,3) #常用的向量寫法，意為將x定義為由元素1，2，3組成的向量。
x
x<- 1:10 #從1-10之間所有的整數(shù)
x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之間每隔0.5取一個數(shù)（注意是逗號不是分號）
x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重復(fù)2次
x
賦值
2.從向量中提取元素
（1）根據(jù)元素位置
#這里的x是你剛才賦值的變量名，根據(jù)自己的情況來修改
x[4] #x第4個元素
x[-4]#排除法，除了第4個元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4個元素
x[-(2:4)]#除了第2-4個元素
x[c(1,5)] #第1個和第5個元素
根據(jù)位置提取元素
（2）根據(jù)值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
根據(jù)值提取元素
數(shù)據(jù)框
1.讀取本地?cái)?shù)據(jù)
數(shù)據(jù)要放在工作目錄
讀取本地?cái)?shù)據(jù)
csv（逗號分隔符文本），txt（Tab分隔符或空格分隔符）
csv,txt文本讀入?yún)^(qū)分
2.設(shè)置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個數(shù)據(jù)框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默認(rèn)值的行名就是行號，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回?cái)?shù)據(jù)，左上角第一格為空，R會自動補(bǔ)為x,用這個命令來修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名
修改第一列列名
修改第一列為行名
3.數(shù)據(jù)框的導(dǎo)出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改為逗號，字符串不加雙引號（默認(rèn)格式帶雙引號）
4.變量的保存與重新加載
#這次沒有處理完的數(shù)據(jù)下次想接著用怎么辦?--學(xué)會保存和重新加載。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當(dāng)前所有變量
save(X,file="test.RData")#保存其中一個變量
load("test.RData")#再次使用RData時的加載命令
變量保存和重新加載
5.提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（優(yōu)秀寫法，而且這個命令還優(yōu)秀到不用寫括號的地步，并且支持Tab自動補(bǔ)全哦，不過只能提取一列）
提取元素
6.直接使用數(shù)據(jù)中的變量
提取某兩列做散點(diǎn)圖
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)
case和values是兩個單純的列名，沒別的意思
簡便方法
- attach
attach(a)
plot(case,values)
- with
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并賦值給x,<<的意思是作為全局變量，也就是出了大括號仍有效。
})
x #運(yùn)行完后打印x
思維導(dǎo)圖
數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu).png
文中部分文字和圖片來自生信星球公眾號
