在GEO檢索時，總能見到一些奇怪命名的樣本，這或許與測序時的脫敏相關(guān)，但這也給后續(xù)數(shù)據(jù)使用時的篩選帶來不便，本期主要介紹一個數(shù)據(jù)庫，能大大提高樣本篩選時的效率
1. 擬解決的問題
1.1 樣本名稱不明確
在GEO數(shù)據(jù)庫挖掘中，會遇到以上這樣的情況，樣本名是一個代碼，如果要看每個樣本具體的處理情況，就需要單個點擊每個GSM樣本來查看，非常費勁
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1.2 樣本量大
300多個樣本，一個個看也特別麻煩
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2. 數(shù)據(jù)庫介紹
數(shù)據(jù)庫地址
https://haoran-chen.shinyapps.io/GEO_Sample_DataBase/
功能
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使用方法及功能
- 輸入GSE id，點擊Search
- 右側(cè)出現(xiàn)所有樣本的詳細(xì)信息
- 可以實現(xiàn)篩選、排序功能
- 篩選結(jié)束后可下載
3. 小結(jié)
大道至簡，小小數(shù)據(jù)庫實現(xiàn)單一的功能，在枯燥的科研中提升一點點效率，有需要的話可以使用，如果有建議或意見，還請聯(lián)系指正！
感謝觀看，如果有用還請點贊，關(guān)注
