關(guān)于微生物全基因組測序的應(yīng)用在當(dāng)今生命科學(xué)領(lǐng)域的研究中有著著至關(guān)重要的作用。

今天來分享一下基于全基因組測序的拼接：

拼接分析原理

測序儀器一次測量的長度有限，通常會對樣本中的序列進(jìn)行飽和式測量，原始數(shù)據(jù)文件中會包含大量來自基因不同位置、長度不同的短序列。拼接工作將這些短序列按照一定順序排列并篩除重復(fù)部分，合成長序列。

全基因組測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控及拼接服務(wù)通過數(shù)據(jù)拼接算法（Velvet、SPAdes）及k-mer值優(yōu)化選擇，進(jìn)行數(shù)據(jù)拼接；同時依據(jù)大樣本分析結(jié)果，可對原始數(shù)據(jù)、質(zhì)控后數(shù)據(jù)、拼接數(shù)據(jù)進(jìn)行可靠性評估，并通過顏色標(biāo)記直觀指示樣品測序數(shù)據(jù)可靠性，保證數(shù)據(jù)分析準(zhǔn)確度，包括N50、NonACGT堿基數(shù)目、GC含量、contig數(shù)目等。

兩個或多個基因測序結(jié)果要如何拼接呢？直接在微生物數(shù)據(jù)分析平臺進(jìn)行批量拼接分析（沙門氏菌），同時并行處理多項(xiàng)數(shù)據(jù)，最后以圖形展現(xiàn)，更直觀。