近日看到R語(yǔ)言中文社區(qū)上一篇關(guān)于Windows的Linux子系統(tǒng)搭建Python和R環(huán)境的文章，加上蝦神也在宣傳，于是我也動(dòng)手來(lái)玩一玩。之前很早就了解過(guò)WSL，但一直沒(méi)動(dòng)手使用，趁機(jī)來(lái)學(xué)習(xí)一下。
1 Windows Subsystem for Linux(WSL)簡(jiǎn)介
簡(jiǎn)介一下WSL。
Windows Subsystem for Linux（簡(jiǎn)稱WSL）是一個(gè)為在Windows 10上能夠原生運(yùn)行Linux二進(jìn)制可執(zhí)行文件（ELF格式）的兼容層。它是由微軟與Canonical公司合作開(kāi)發(fā)，目標(biāo)是使純正的Ubuntu 14.04 "Trusty Tahr"映像能下載和解壓到用戶的本地計(jì)算機(jī)，并且映像內(nèi)的工具和實(shí)用工具能在此子系統(tǒng)上原生運(yùn)行。WSL提供了一個(gè)微軟開(kāi)發(fā)的Linux兼容內(nèi)核接口（不包含Linux代碼），來(lái)自Ubuntu的用戶模式二進(jìn)制文件在其上運(yùn)行。該子系統(tǒng)不能運(yùn)行所有Linux軟件，例如那些圖形用戶界面，以及那些需要未實(shí)現(xiàn)的Linux內(nèi)核服務(wù)的軟件。不過(guò)，這可以用在外部X服務(wù)器上運(yùn)行的圖形X Window系統(tǒng)緩解。此子系統(tǒng)起源于命運(yùn)多舛的Astoria項(xiàng)目，其目的是允許Android應(yīng)用運(yùn)行在Windows 10 Mobile上。此功能組件從Windows 10 Insider Preview build 14316開(kāi)始可用?！S基百科
2 WSL安裝
在開(kāi)始菜單里搜索"Microsoft Store"。
接著在"Microsoft Store"中搜索"Linux"。
從中選擇一個(gè)Linux的發(fā)行版安裝即可。我選的是Ubuntu 18.04 LTS，個(gè)人比較熟悉Ubuntu，同時(shí)也想試一下18.04版本。點(diǎn)擊獲取后，"Microsoft Store"就會(huì)自動(dòng)下載安裝。當(dāng)然安裝完后，你可以把它固定到開(kāi)始屏幕比較方便。
當(dāng)然現(xiàn)在啟動(dòng)WSL是失敗的，因?yàn)檫€得在Windows中啟用該功能。依舊是在開(kāi)始菜單搜索Windows功能。
接著打鉤"適用于Linux的Windows子系統(tǒng)"。
這個(gè)時(shí)候就能愉快地開(kāi)啟Ubuntu系統(tǒng)了（當(dāng)然一般上面勾選完需要重啟系統(tǒng)，這類就跳過(guò)了）。
如果第一次啟動(dòng)的話，會(huì)要求你創(chuàng)建一個(gè)Linux的賬戶和密碼，熟悉Linux系統(tǒng)的同學(xué)應(yīng)該很清楚了，這就不多說(shuō)了，如果不熟悉的，建議去學(xué)習(xí)一下Linux的基礎(chǔ)管理和操作。這樣就愉快地可以開(kāi)始在Windows上玩耍Linux系統(tǒng)了。另外這個(gè)系統(tǒng)其實(shí)是安裝在如下的地址內(nèi)，這樣子后期管理時(shí)也可以快速上手使用。
C:\Users\你的用戶名\AppData\Local\Packages\CanonicalGroupLimited.Ubuntu18.04onWindows_79rhkp1fndgsc\LocalState\rootfs
同時(shí)WSL直接將你的其他磁盤(pán)掛載到了mnt文件夾下面，可以直接通過(guò)/mnt/d訪問(wèn)。
cd /mnt/f
ls -l
如果覺(jué)得下載速度略慢的話，完全可以更新apt源文件來(lái)提速?？梢钥吹皆?etc/apt下面的sources.list
我們這里在自己的F盤(pán)創(chuàng)建了一個(gè)WSL的工作空間，可以用來(lái)做各種相關(guān)的事情，譬如這里在更新apt源文件前，先備份到這個(gè)空間內(nèi)。需要提醒下，我這里都先運(yùn)行了sudo su，以root賬戶執(zhí)行。所以不需要在命令前加sudo，如果不是root賬戶，請(qǐng)加sudo。
mkdir /mnt/f/WSLworkspace
cp /etc/apt/sources.list /mnt/f/WSLworkspace/sourcesbackup.list
而替換源通常使用vim或者gedit來(lái)操作，這個(gè)時(shí)候知道我們的系統(tǒng)安裝路徑的好處就來(lái)了。只需要在Windows上打開(kāi)對(duì)應(yīng)文件夾下的sources.list（建議用Notepad++），復(fù)制粘貼就可以。給出幾個(gè)源。
清華
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
阿里源
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
中科大
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
deb-src https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
接著就可以進(jìn)行更新軟件了。
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
3 WSL搭建數(shù)據(jù)科學(xué)環(huán)境
接下來(lái)就是搭建數(shù)據(jù)科學(xué)環(huán)境（Python和R）了。這里推薦安裝Anaconda，當(dāng)然如果想從頭開(kāi)始安裝也是允許的。先去Anaconda 官網(wǎng)找到最新的版本。我Windows上基本都是Python2，因此在這個(gè)版本上主要以Python3為主，就是圖中紅框的。下載鏈接如下。
https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh
接著用wget下載，可以改變路徑。
wget -P /mnt/f/WSLworkspace https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh
接下來(lái)就是安裝Anaconda3。
bash /mnt/f/WSLworkspace/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh
中間可以選擇安裝位置，這里默認(rèn)安裝在/root/Anaconda3，接著就等待安裝結(jié)束了。安裝過(guò)程中會(huì)提示是否將Anaconda3添加到環(huán)境變量，選yes。安裝完會(huì)提示是否要安裝Microsoft VS code，我建議可以不裝。接著再Linux命令行里敲入。
jupyter lab --allow-root
關(guān)于這個(gè)的配置有一些參考的內(nèi)容見(jiàn)后面的鏈接，這里不詳細(xì)展開(kāi)，如果以root賬戶運(yùn)行的話必須加上--allow -root。
接著在Windows瀏覽器里訪問(wèn)http://localhost:8888/lab?。
除了Python3，我們還推薦裝個(gè)R，用于混合編程。這個(gè)時(shí)候畢竟本機(jī)已經(jīng)安裝了原生R，我決定在Linux上搭建一個(gè)Microsoft R Open(MRO)。同樣是打開(kāi)MRO官網(wǎng)
利用wget下載MRO。
wget -P /mnt/f/WSLworkspace https://mran.blob.core.windows.net/install/mro/3.5.1/microsoft-r-open-3.5.1.tar.gz
由于我用的Ubuntu18.04，還需要安裝libpng12庫(kù)。
wget -P /mnt/f/WSLworkspace https://mirrors.kernel.org/ubuntu/pool/main/libp/libpng/libpng12-0_1.2.54-1ubuntu1_amd64.deb
dpkg -i libpng12-01_1.2.54-1ubuntu1_amd64.deb
定位到MRO下載路徑。
cd /mnt/f/WSLworkspace
tar -xf microsoft-r-open-3.5.1.tar.gz
cd microsoft-r-open
./install.sh
接著需要看MRO和MKL的許可，先按回車看許可，接著按q鍵退出，按y進(jìn)行安裝。
R安裝好后，還需要配置到j(luò)upyter中。首先需要先安裝devtools，Ubuntu 18.04還需要先安裝libssl。
apt-get install libssl-dev
接著進(jìn)入到R中。
install.packages('devtools'）
library(devtools)
install_github('IRKernel/IRkernel')
這邊發(fā)現(xiàn)IRkernel裝不上，還需要裝libcurl。
apt-get install libcurl4-openssl-dev
最后發(fā)現(xiàn)github連接老有問(wèn)題。
Github也有一個(gè)相同的issues，可以安裝離線包，在github上點(diǎn)擊clone or download，下載到文件夾中。
devtools::install('/mnt/f/WSLworkspacre/IRkernel-master')
終于安裝成功。最后在R里，再敲入如下命令。
IRkernel::installspec(name = 'ir35', displayname = 'MRO')
大功告成。
運(yùn)行一波代碼。
雖然R語(yǔ)言中文社區(qū)給出了比較完整的教程，但是具體搭建過(guò)程中，還是無(wú)數(shù)的坑。希望大家也是動(dòng)手實(shí)踐為主。最近發(fā)現(xiàn)好多需要在Linux系統(tǒng)上安裝的包和庫(kù)，因此有這個(gè)環(huán)境非常地好。
參考鏈接：
再見(jiàn)虛擬機(jī)！在Win10中使用Linux版本的R和Python
Ubuntu 18.04 軟件源修改成國(guó)內(nèi)源（文件或界面形式）
設(shè)置 jupyter notebook 可遠(yuǎn)程訪問(wèn)
Running as root is not recommended. Use --allow-root to bypass
Running as root is not recommended. Use --allow-root to bypass
Github Issues:Installation of packages using Devtools Fails - error setting certificate
error setting certificate verify locations, install_github
無(wú)法安裝github上的R包：error setting certificate verify
Github Issues:Installation failed: Timeout was reached during installation of IRkernel
