禽流感與新城疫在臨床上不容易區(qū)分，常常治好了病也不知道到底發(fā)生的是哪一種疫病。而由于禽流感與新城疫的治療方法完全不一樣，一旦誤診會帶來嚴重問題，延誤治療，帶來損失。
一、臨床癥狀：臨床上，出現(xiàn)輕微或嚴重呼吸困難也就是雞呼嚕咳嗽，有呼吸道癥狀，不出現(xiàn)腫頭腫臉的雞只 ，多是H7禽流感。
1.糞便：溫和型禽流感：初期：拉稀；中期：拉黃、綠或黃綠融合的稀便；后期：部分或少量拉橘黃色稀便。
新城疫：絕對不出現(xiàn)橘黃色糞便。
2.神經(jīng)癥狀：新城疫個別雞只會有扭頭，神經(jīng)癥狀較常見 ，禽流感不多見，但是有的在后期出現(xiàn)神經(jīng)癥狀。
3.呼吸道癥狀:新城疫以呼嚕為主，禽流感出現(xiàn)輕微或嚴重呼吸困難 ，一般出現(xiàn)“咳咳”，但是較難以區(qū)分。
4.嗉囊積液：新城疫倒提，可從口中流出酸臭嗉囊積液，禽流感沒有。
二、剖檢：
1.胸腺：肉雞和蛋雞開產(chǎn)前看胸腺變化，蛋雞胸腺在60-80日齡最大，以后逐漸退化萎縮。
溫和型禽流感：先出現(xiàn)出血和腫脹的是在下面幾對胸腺。病情嚴重程度和出血變化和位置有關(guān)，初期是后幾對（下）胸腺先有出血點和腫大，越往下出血、腫脹說明發(fā)病時間越早越嚴重；
新城疫：變化在1-4對胸腺，出現(xiàn)出血、腫大的胸腺越靠前幾對（上），說明發(fā)病時間越早越嚴重。
2.盲腸扁桃體：
新城疫：絕對要出現(xiàn)嚴重的出血、腫脹變化。但出現(xiàn)盲腸扁桃體腫脹出血的不一定是新城疫，不出現(xiàn)盲腸扁桃體腫脹出血的絕對不是新城疫，這一點高度重視；
禽流感：有部分引起盲腸扁桃體的腫脹出血，有很大部分不引起嚴重出血。要多解剖，看到底有沒有盲腸扁桃體不出血，或輕微出出血的或輕微腫大不出血的，如有這些變化就是溫和型禽流感。不論蛋雞還是肉雞、種雞都適用。
3.腸道淋巴集結(jié)：
1>12指腸降攀（下段），正常的此處淋巴集結(jié)呈條狀不規(guī)則的島嶼狀（2-3厘米）是白色隱性不出現(xiàn)明顯的島嶼。新城疫和禽流感發(fā)病后島嶼明顯出現(xiàn)，上面有1個以上明顯的出血點。禽流感出血：彌漫性的；新城疫:不呈彌漫性。
2>卵黃蒂后2-6厘米的淋巴弧結(jié)，主要是半個黃豆大?。盒鲁且哂凶兓萘鞲幸话銢]有變化。典型或非典型新城疫只出現(xiàn)隆起有1個或多個出血或整個出血。強毒新城疫出現(xiàn)潰瘍，并覆蓋粘液性綠色物質(zhì)。嚴重的禽流感也處出現(xiàn)白色輪廓。
4.回腸淋巴結(jié)核和盲腸細段淋巴結(jié)：
1>新城疫兩條盲腸之間的回盲淋巴結(jié)是棗核狀隆起或出血；禽流感不明顯。
2>新城疫盲腸細段淋巴結(jié)呈1個或半個小米粒狀突起并出血；禽流感沒有變化。
5.直腸粘膜:新城疫：呈條狀出血；腎傳支呈點狀密密麻麻的出血點。
6.腹膜炎:溫和禽流感：呈現(xiàn)纖維性性腹膜炎，呈黃色。蛋雞前期也是纖維素性腹膜炎，后期才是出現(xiàn)卵黃性腹膜炎；
新城疫：基本不出現(xiàn)腹膜炎，后期有可能出現(xiàn)輕微的卵黃性腹膜炎。要多解剖幾只就找到共同規(guī)律。
7.腺胃乳頭：新城疫：出血在乳頭部；禽流感：出血在乳頭的基部，也有整個乳頭出血的，有的整合腺胃粘膜發(fā)紅出血。
8.腎臟變化：禽流感：引起腎臟腫脹發(fā)紅，有輕微的尿酸鹽沉積在輸尿管；新城疫：沒有這個變化。
9.腸道內(nèi)出血：流感引起的規(guī)則圓點狀，1個或多個米粒大小的出血極像球蟲。但是禽流感的用剪刀刮沒有明顯滲血感覺；新城疫：沒有這種變化。
三、與其他疫病的區(qū)別
1.H9溫和禽流感和鼻炎的區(qū)別：
H9溫和禽流感：引起的腫頭、腫臉外觀硬腫，呈蒼白色，一般肉垂不引起腫大或不單獨引起腫大（看似腫大多因為肉垂基部硬脹后出現(xiàn)的撅翹）；
鼻炎：引起的腫頭、腫臉淡紅色浮腫，手壓有波動感或柔軟感，并同時出現(xiàn)肉垂腫脹。
2.H9禽流感與腫頭、腫臉大腸桿菌的區(qū)別：二者的腫脹的性狀在臨床上是一模一樣。
腫頭腫臉大腸桿菌：1>不引起呼吸道癥狀；2>腫脹比例小在0.1-0.2%之間；3>不流鼻涕；4>大群中沒有癥狀的雞仍大吃大喝，產(chǎn)蛋率、蛋殼顏色正常；5>患病雞拉白色稀便，且只要不注射相應抗大腸桿菌的藥物，出現(xiàn)一個死一個；6>用敏感的抗菌藥很快控制患病雞出現(xiàn)。
3.H9禽流感與H7禽流感的區(qū)別：共同點：H9有H7的幾乎所有解剖癥狀，臨床H7沒有腫頭、腫臉，而H9多見。
區(qū)別：H9有嚴重的腹膜炎、肝周炎、心包炎——“三炎”且不臭。H7沒有或不嚴重。
4. H9禽流感與普通大腸桿菌的區(qū)別：1>共同點都有“三炎”，但是H9不臭，大腸桿菌惡臭；2> H9有1只或多只腫頭腫臉還有呼吸道癥狀，大腸桿菌沒有；3>糞便顏色： H9有橘黃色糞便，大腸桿菌糞便是白色稀便；4> H9腎臟發(fā)紅和有輕微的尿酸鹽。
