原文傳送門(mén)：PDB-101: Learn: Guide to Understanding PDB Data: Dealing with Coordinates (rcsb.org)
Atomic-level Data
一個(gè)典型的PDB條目將包含蛋白質(zhì)、小分子、離子和水的不同集合的原子坐標(biāo)。
坐標(biāo)部分的每個(gè)原子都由條目文件中的順序號(hào)、具體的原子名稱、所屬殘基的名稱和編號(hào)、指定鏈的單字母代碼、其X、Y和Z坐標(biāo)以及占用和溫度系數(shù)來(lái)識(shí)別。
在PDBx/mmCIF格式中，這些信息被存儲(chǔ)在_atom_site類別中。下面顯示的是條目4HHB的這一部分的前幾行。
loop_
_atom_site.group_PDB # ATOM記錄用于識(shí)別蛋白質(zhì)或核酸原子，HETATM記錄用于識(shí)別小分子的原子
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol # 原子類型
_atom_site.label_atom_id # 原子標(biāo)簽
_atom_site.label_alt_id # 異構(gòu)體
_atom_site.label_comp_id # 所屬殘基
_atom_site.label_asym_id # 不同鏈
_atom_site.label_entity_id # 鏈編號(hào)
_atom_site.label_seq_id # 殘基序號(hào)
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x # X坐標(biāo)
_atom_site.Cartn_y # Y坐標(biāo)
_atom_site.Cartn_z # Z坐標(biāo)
_atom_site.occupancy # 晶體中(包含了多個(gè)單個(gè)的相同分子)不同構(gòu)象的比例
_atom_site.B_iso_or_equiv # 表示電子密度拖尾的情況，越大拖尾越嚴(yán)重，表明原子運(yùn)動(dòng)得越厲害
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id # 殘基序號(hào)
_atom_site.auth_comp_id # 殘基種類
_atom_site.auth_asym_id # 不同鏈
_atom_site.auth_atom_id # 原子類型
_atom_site.pdbx_PDB_model_num # 模型編號(hào)(NMR可能產(chǎn)生多種不同的模型)
ATOM 1 N N . LYS A 1 7 ? 12.364 -13.639 8.445 1.00 54.67 ? 527 LYS A N 1
ATOM 2 C CA . LYS A 1 7 ? 11.119 -12.888 8.550 1.00 49.59 ? 527 LYS A CA 1
ATOM 3 C C . LYS A 1 7 ? 9.961 -13.651 7.926 1.00 44.77 ? 527 LYS A C 1
ATOM 4 O O . LYS A 1 7 ? 9.055 -14.126 8.617 1.00 49.39 ? 527 LYS A O 1
ATOM 5 C CB . LYS A 1 7 ? 11.255 -11.538 7.841 1.00 49.41 ? 527 LYS A CB 1
ATOM 6 C CG . LYS A 1 7 ? 10.169 -10.531 8.174 1.00 53.16 ? 527 LYS A CG 1
ATOM 7 C CD . LYS A 1 7 ? 10.523 -9.771 9.432 1.00 59.71 ? 527 LYS A CD 1
ATOM 8 C CE . LYS A 1 7 ? 11.779 -8.947 9.195 1.00 63.60 ? 527 LYS A CE 1
ATOM 9 N NZ . LYS A 1 7 ? 12.353 -8.381 10.443 1.00 64.85 ? 527 LYS A NZ 1
ATOM 10 N N . ARG A 1 8 ? 10.011 -13.762 6.603 1.00 40.03 ? 528 ARG A N 1
<snip>
在PDB文件格式中，ATOM記錄用于識(shí)別蛋白質(zhì)或核酸原子，HETATM記錄用于識(shí)別小分子的原子。下面顯示的是4HHB條目這一部分的前幾行。
ATOM 1 N LYS A 527 12.364 -13.639 8.445 1.00 54.67 N
ATOM 2 CA LYS A 527 11.119 -12.888 8.550 1.00 49.59 C
ATOM 3 C LYS A 527 9.961 -13.651 7.926 1.00 44.77 C
ATOM 4 O LYS A 527 9.055 -14.126 8.617 1.00 49.39 O
ATOM 5 CB LYS A 527 11.255 -11.538 7.841 1.00 49.41 C
ATOM 7 CD LYS A 527 10.523 -9.771 9.432 1.00 59.71 C
ATOM 8 CE LYS A 527 11.779 -8.947 9.195 1.00 63.60 C
ATOM 9 NZ LYS A 527 12.353 -8.381 10.443 1.00 64.85 N
ATOM 10 N ARG A 528 10.011 -13.762 6.603 1.00 40.03 N
這些信息讓你在探索結(jié)構(gòu)時(shí)有很多控制權(quán)。例如，大多數(shù)分子圖形程序使您能夠有選擇地給分子的確定部分著色--例如，挑選出所有的碳原子并將其染成綠色，或者挑選一個(gè)特定的氨基酸并將其突出顯示。
Chains and Models
生物分子是有層次的，從原子到殘基到鏈到組合體。坐標(biāo)文件包含組織和指定所有這些層次的分子的方法。如上所述，原子名稱和殘基信息都包含在每個(gè)原子記錄中。
在PDBx/mmCIF格式中，記錄的循環(huán)性質(zhì)使得它很容易代表不同的鏈和多個(gè)分子。
下面顯示的是條目4hhb的一個(gè)片段，顯示了從鏈A到鏈B的過(guò)渡，其中鏈在_atom_site.label_asym_id記錄中被指定，并在_atom_site.label_entity_id記錄中被進(jìn)一步識(shí)別。請(qǐng)參閱《PDB結(jié)構(gòu)和PDBx/mmCIF格式初學(xué)者指南》以了解對(duì)實(shí)體的介紹。
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . VAL A 1 1 ? 6.204 16.869 4.854 1.00 49.05 ? 1 VAL A N 1
ATOM 2 C CA . VAL A 1 1 ? 6.913 17.759 4.607 1.00 43.14 ? 1 VAL A CA 1
ATOM 3 C C . VAL A 1 1 ? 8.504 17.378 4.797 1.00 24.80 ? 1 VAL A C 1
<snip>
ATOM 1067 N NH1 . ARG A 1 141 ? -10.147 7.455 -6.079 1.00 23.24 ? 141 ARG A NH1 1
ATOM 1068 N NH2 . ARG A 1 141 ? -8.672 8.328 -4.506 1.00 33.34 ? 141 ARG A NH2 1
ATOM 1069 O OXT . ARG A 1 141 ? -9.474 13.682 -9.742 1.00 31.52 ? 141 ARG A OXT 1
ATOM 1070 N N . VAL B 2 1 ? 9.223 -20.614 1.365 1.00 46.08 ? 1 VAL B N 1
ATOM 1071 C CA . VAL B 2 1 ? 8.694 -20.026 -0.123 1.00 70.96 ? 1 VAL B CA 1
ATOM 1072 C C . VAL B 2 1 ? 9.668 -21.068 -1.645 1.00 69.74 ? 1 VAL B C 1
ATOM 1073 O O . VAL B 2 1 ? 9.370 -22.612 -0.994 1.00 71.82 ? 1 VAL B O 1
<snip>
在這里，對(duì)于解NMR集合結(jié)構(gòu)條目1vre，_atom_site.pdbx_PDB_model_num記錄被用來(lái)表示文件中代表的29種不同的模型：
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . GLY A 1 1 ? 13.878 9.721 9.134 1.00 0.00 ? 1 GLY A N 1
ATOM 2 C CA . GLY A 1 1 ? 12.761 8.747 8.973 1.00 0.00 ? 1 GLY A CA 1
ATOM 3 C C . GLY A 1 1 ? 13.273 7.506 8.239 1.00 0.00 ? 1 GLY A C 1
<snip>
HETATM 2175 H HBD2 . HEM B 2 . ? -8.871 3.884 -8.248 1.00 0.00 ? 148 HEM A HBD2 1
HETATM 2176 C C . CMO C 3 . ? -7.184 0.894 -1.865 1.00 0.00 ? 149 CMO A C 1
HETATM 2177 O O . CMO C 3 . ? -7.008 -0.217 -1.956 1.00 0.00 ? 149 CMO A O 1
ATOM 2178 N N . GLY A 1 1 ? 11.063 9.378 8.937 1.00 0.00 ? 1 GLY A N 2
ATOM 2179 C CA . GLY A 1 1 ? 10.504 8.078 8.473 1.00 0.00 ? 1 GLY A CA 2
ATOM 2180 C C . GLY A 1 1 ? 11.648 7.196 7.970 1.00 0.00 ? 1 GLY A C 2
<snip>
HETATM 63131 H HBD2 . HEM B 2 . ? -8.603 4.604 -7.315 1.00 0.00 ? 148 HEM A HBD2 29
HETATM 63132 C C . CMO C 3 . ? -7.211 0.912 -1.966 1.00 0.00 ? 149 CMO A C 29
HETATM 63133 O O . CMO C 3 . ? -7.058 -0.203 -2.022 1.00 0.00 ? 149 CMO A O 29
#
在PDB文件格式中，TER記錄被用來(lái)分離蛋白質(zhì)和核酸不同的鏈。這些鏈一個(gè)接一個(gè)地包含在文件中，用TER記錄隔開(kāi)，表示這些鏈之間沒(méi)有物理連接。大多數(shù)分子圖形程序會(huì)尋找這個(gè)TER記錄，這樣他們就不會(huì)畫(huà)出連接不同鏈的鍵。下圖是條目4HHB的部分，其中TER記錄被用來(lái)分隔α鏈的第一份（A鏈）和β鏈的第一份（B鏈）。
ATOM 1067 NH1 ARG A 141 -10.147 7.455 -6.079 1.00 23.24 N
ATOM 1068 NH2 ARG A 141 -8.672 8.328 -4.506 1.00 33.34 N
ATOM 1069 OXT ARG A 141 -9.474 13.682 -9.742 1.00 31.52 O
TER 1070 ARG A 141
ATOM 1071 N VAL B 1 9.223 -20.614 1.365 1.00 46.08 N
ATOM 1072 CA VAL B 1 8.694 -20.026 -0.123 1.00 70.96 C
ATOM 1073 C VAL B 1 9.668 -21.068 -1.645 1.00 69.74 C
ATOM 1074 O VAL B 1 9.370 -22.612 -0.994 1.00 71.82 O
ATOM 1075 CB VAL B 1 9.283 -18.281 -0.381 1.00 59.18 C
ATOM 1076 CG1 VAL B 1 7.449 -17.518 -0.791 1.00 57.89 C
B鏈和C鏈將被類似地分開(kāi)，C鏈和D鏈也是如此。
PDB格式文件使用MODEL/ENDMDL關(guān)鍵字來(lái)表示一個(gè)文件中的多個(gè)分子。這最初是為了存檔包括同一結(jié)構(gòu)的幾個(gè)不同模型的坐標(biāo)集，如核磁共振分析中獲得的結(jié)構(gòu)組合。當(dāng)你查看這些文件時(shí)，你會(huì)看到幾十個(gè)類似的分子全部疊加在一起。現(xiàn)在，MODEL關(guān)鍵詞也被用于生物組裝文件中，以分離從不對(duì)稱單元中生成的許多對(duì)稱的分子拷貝（更多信息請(qǐng)參見(jiàn)生物組裝教程）。
下面顯示的是條目1out的生物組裝文件的一個(gè)部分，它包含不對(duì)稱單元中血紅蛋白模型的一半（A鏈和B鏈）。完整的4鏈分子在生物組裝文件中可以找到，其中的兩組兩鏈被MODEL記錄分開(kāi)。
<snip>
MODEL 1
HETATM 1 C ACE A 0 40.573 27.347 55.464 1.00 42.49 C
HETATM 2 O ACE A 0 41.130 27.445 56.567 1.00 50.27 O
HETATM 3 CH3 ACE A 0 39.709 28.526 55.115 1.00 49.32 C
<snip>
HETATM 2475 O HOH B 238 8.440 58.387 54.230 1.00 67.86 O
HETATM 2476 O HOH B 239 23.699 54.828 72.752 1.00 71.63 O
HETATM 2477 O HOH B 240 30.823 46.229 47.604 1.00 71.95 O
ENDMDL
MODEL 2
HETATM 1 C ACE A 0 50.950 33.338 48.783 1.00 42.49 C
HETATM 2 O ACE A 0 50.587 32.905 47.680 1.00 50.27 O
HETATM 3 CH3 ACE A 0 50.361 34.676 49.132 1.00 49.32 C
<snip>
HETATM 2475 O HOH B 238 40.135 76.686 50.017 1.00 67.86 O
HETATM 2476 O HOH B 239 35.588 61.692 31.495 1.00 71.63 O
HETATM 2477 O HOH B 240 39.473 51.223 56.643 1.00 71.95 O
ENDMDL
MASTER 0 0 0 16 0 0 8 6 2475 2 0 23
END
Temperature Factors
如果我們能夠?qū)⒁粋€(gè)原子僵硬地固定在一個(gè)地方，我們可以在理想的情況下觀察它的電子分布。圖像中的電子會(huì)向中心密集，距離原子核越遠(yuǎn)密度越小。然而，當(dāng)你觀察實(shí)驗(yàn)中的電子密度分布時(shí)，電子的分布通常比這種理想情況更寬。這可能是由于原子的振動(dòng)，或者晶格中許多不同分子之間的差異。觀察到的電子密度將包括所有這些小的運(yùn)動(dòng)的平均值，產(chǎn)生一個(gè)略微模糊的分子圖像。
這些運(yùn)動(dòng)，以及由此產(chǎn)生的電子密度拖尾，通過(guò) B 值或溫度因子結(jié)合到原子模型中。拖尾量與 B 值的大小成正比。低于 10 的值會(huì)創(chuàng)建一個(gè)非常銳利的原子模型，這表明原子移動(dòng)不大，并且在晶體中的所有分子中處于相同位置。大于 50 左右的值表明原子移動(dòng)得太快以至于幾乎看不到它。蛋白質(zhì)表面的原子通常是這種情況，其中長(zhǎng)側(cè)鏈可以在周?chē)乃凶杂蓴[動(dòng)。
在 PDBx/mmCIF 格式中，_atom_site.B_iso_or_equiv 記錄用于存儲(chǔ)溫度因子值。再次來(lái)自條目 4hhb：
<snip>
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv # B值
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . VAL A 1 1 ? 6.204 16.869 4.854 1.00 49.05 ? 1 VAL A N 1
ATOM 2 C CA . VAL A 1 1 ? 6.913 17.759 4.607 1.00 43.14 ? 1 VAL A CA 1
ATOM 3 C C . VAL A 1 1 ? 8.504 17.378 4.797 1.00 24.80 ? 1 VAL A C 1
<snip>
在PDB文件格式中，溫度系數(shù)在第61-66列中給出。從條目4hhb：
<snip>
ATOM 1 N VAL A 1 6.204 16.869 4.854 1.00 49.05 N
ATOM 2 CA VAL A 1 6.913 17.759 4.607 1.00 43.14 C
ATOM 3 C VAL A 1 8.504 17.378 4.797 1.00 24.80 C
<snip>
所示示例來(lái)自以 2.0 ? 分辨率解析的肌紅蛋白結(jié)構(gòu)（PDB 條目 1mbi）。顯示了兩個(gè)組氨酸氨基酸。左邊是 HIS93，它與鐵原子配位，因此被牢牢固定在適當(dāng)?shù)奈恢谩Ｋ?B 值在 15-20 范圍內(nèi)——注意輪廓如何很好地圍繞整個(gè)氨基酸，顯示出尖銳的電子密度。右邊是HIS81，暴露在蛋白質(zhì)表面，B值較高，在22-74范圍內(nèi)。還要注意輪廓如何包圍更小的空間，顯示該氨基酸具有高電子密度的較小區(qū)域，因?yàn)檎w電子密度在輪廓周?chē)目臻g中被微弱地涂抹。
上圖顯示的是整個(gè)分子，原子的顏色由溫度因素決定。表示大量運(yùn)動(dòng)的高值為紅色和黃色，而低值為藍(lán)色。請(qǐng)注意，蛋白質(zhì)內(nèi)部的B值較低，而表面的氨基酸的B值較高。
提示：溫度系數(shù)是衡量我們對(duì)每個(gè)原子位置的信心。如果你在一個(gè)蛋白質(zhì)的表面發(fā)現(xiàn)了一個(gè)溫度系數(shù)很高的原子，請(qǐng)記住，這個(gè)原子可能是經(jīng)常移動(dòng)的，在PDB文件中指定的坐標(biāo)只是其位置的一個(gè)可能快照。
Occupancy and Multiple Conformations
大分子晶體由許多單獨(dú)的分子組成，排列成對(duì)稱排列。在某些晶體中，這些分子中的每一個(gè)之間都有細(xì)微的差異。例如，表面上的側(cè)鏈可能在幾個(gè)構(gòu)象之間來(lái)回?cái)[動(dòng)，或者底物可能在活性位點(diǎn)中以兩個(gè)方向結(jié)合，或者金屬離子可能僅與少數(shù)分子結(jié)合。當(dāng)研究人員建立這些部分的原子模型時(shí)，他們可以使用占用率來(lái)估計(jì)在晶體中觀察到的每種構(gòu)象的數(shù)量。對(duì)于大多數(shù)原子，占有率為 1，表明該原子存在于晶體中同一位置的所有分子中。但是，如果金屬離子僅與晶體中一半的分子結(jié)合，研究人員將在電子密度圖中看到該離子的弱圖像，并且可以在 PDB 結(jié)構(gòu)文件中為該原子分配 0.5 的占用率。占用也常用于識(shí)別在多種構(gòu)象中觀察到的側(cè)鏈或配體。占有率值用于指示具有每種構(gòu)象的分子的分?jǐn)?shù)。每個(gè)原子包含兩個(gè)（或更多）原子記錄，占用率如 0.5 和 0.5，或 0.4 和 0.6，或其他總和為 1 的分?jǐn)?shù)占用率。
肌紅蛋白中的交替構(gòu)象：圖中的兩幅圖像取自條目1a6m中肌紅蛋白的高分辨率結(jié)構(gòu)：左邊是谷氨酰胺8，右邊是酪氨酸151。在這兩種情況下，保存人將實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)解釋為顯示了氨基酸的兩種構(gòu)象，谷氨酰胺的占據(jù)率為0.57和0.43，而酪氨酸構(gòu)象的占據(jù)率為0.5。藍(lán)色的輪廓線圍繞著高電子密度的區(qū)域，原子模型用棍子表示。
提示：在處理具有多個(gè)坐標(biāo)的 PDB 條目時(shí)，您通常需要密切注意。并不總是可以只選擇“A”構(gòu)象并丟棄“B”構(gòu)象。您需要仔細(xì)查看每種情況，并確保移動(dòng)側(cè)鏈之間沒(méi)有任何不良接觸。
在 PDBx/mmCIF 格式中，_atom_site.label_alt_id 類別中指示替代構(gòu)象，_atom_site.occupancy 類別中指示占用。下面顯示的是條目 1a6m 中的殘基 8。
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id # Multiple Conformations
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy # Occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
<snip>
ATOM 63 N N . GLN A 1 8 ? 5.404 13.203 22.532 1.00 8.42 ? 8 GLN A N 1
ATOM 64 C CA . GLN A 1 8 ? 6.475 12.812 23.418 1.00 8.84 ? 8 GLN A CA 1
ATOM 65 C C . GLN A 1 8 ? 7.602 12.149 22.631 1.00 8.08 ? 8 GLN A C 1
ATOM 66 O O . GLN A 1 8 ? 8.769 12.399 22.918 1.00 8.39 ? 8 GLN A O 1
ATOM 67 C CB A GLN A 1 8 ? 5.987 11.822 24.520 0.57 13.03 ? 8 GLN A CB 1
ATOM 68 C CB B GLN A 1 8 ? 5.948 11.968 24.580 0.43 9.68 ? 8 GLN A CB 1
ATOM 69 C CG A GLN A 1 8 ? 7.030 11.303 25.506 0.57 16.30 ? 8 GLN A CG 1
ATOM 70 C CG B GLN A 1 8 ? 6.967 12.094 25.688 0.43 12.07 ? 8 GLN A CG 1
ATOM 71 C CD A GLN A 1 8 ? 7.981 10.227 25.063 0.57 15.61 ? 8 GLN A CD 1
ATOM 72 C CD B GLN A 1 8 ? 6.439 11.470 26.952 0.43 14.43 ? 8 GLN A CD 1
ATOM 73 O OE1 A GLN A 1 8 ? 7.688 9.392 24.214 0.57 19.54 ? 8 GLN A OE1 1
ATOM 74 O OE1 B GLN A 1 8 ? 5.419 10.767 26.918 0.43 17.46 ? 8 GLN A OE1 1
ATOM 75 N NE2 A GLN A 1 8 ? 9.219 10.114 25.607 0.57 21.38 ? 8 GLN A NE2 1
ATOM 76 N NE2 B GLN A 1 8 ? 7.067 11.762 28.084 0.43 14.03 ? 8 GLN A NE2 1
在 PDB 文件格式中，使用替代位置指示符在第 17 列中給出了替代構(gòu)象，在第 55 - 60 列中給出了占用率。下面從條目 1a6m 顯示的是以兩種不同構(gòu)象 A 和 B 建模的谷氨酰胺殘基 8，其中構(gòu)象 A給定 57% 的占用率，而構(gòu)象 B 給定 43% 的占用率：
ATOM 63 N GLN A 8 5.404 13.203 22.532 1.00 8.42 N
ATOM 64 CA GLN A 8 6.475 12.812 23.418 1.00 8.84 C
ATOM 65 C GLN A 8 7.602 12.149 22.631 1.00 8.08 C
ATOM 66 O GLN A 8 8.769 12.399 22.918 1.00 8.39 O
ATOM 67 CB AGLN A 8 5.987 11.822 24.520 0.57 13.03 C
ATOM 68 CB BGLN A 8 5.948 11.968 24.580 0.43 9.68 C
ATOM 69 CG AGLN A 8 7.030 11.303 25.506 0.57 16.30 C
ATOM 70 CG BGLN A 8 6.967 12.094 25.688 0.43 12.07 C
ATOM 71 CD AGLN A 8 7.981 10.227 25.063 0.57 15.61 C
ATOM 72 CD BGLN A 8 6.439 11.470 26.952 0.43 14.43 C
ATOM 73 OE1AGLN A 8 7.688 9.392 24.214 0.57 19.54 O
ATOM 74 OE1BGLN A 8 5.419 10.767 26.918 0.43 17.46 O
ATOM 75 NE2AGLN A 8 9.219 10.114 25.607 0.57 21.38 N
ATOM 76 NE2BGLN A 8 7.067 11.762 28.084 0.43 14.03 N
<snip>
