一. 向量

• 向量，元素，標(biāo)量區(qū)別
  圖引自生信星球
  
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• 賦值
  給變量定義就是賦值, 注意以最后一次為準(zhǔn)！注意以下常用表達(dá)
  x<-c(1,2,3) #常用的向量定義寫法，意為將x定義為由元素1，2，3組成的向量。
  x<-(1:10) #從1-10之間所有的整數(shù)
  x<-seq(1,10,by = 0.5)#1-10之間每隔0.5取一個(gè)數(shù)（注意這里是逗號不是分號）
  x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重復(fù)2次
• 從向量中提取元素
  1.根據(jù)元素位置
  這里的x是你剛才賦值的變量名，根據(jù)自己的情況來修改
  x[4] #x第4個(gè)元素
  x[-4]#排除法，除了第4個(gè)元素之外剩余的元素
  x[2:4]#第2到4個(gè)元素
  x[-(2:4)]#除了……
  x[c(1,5)]#第1個(gè)和第5個(gè)元素
  2.根據(jù)值的大小
  x[x==10]#等于10的元素
  x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

二. 數(shù)據(jù)框

• 練習(xí)時(shí)先將doudou.txt和huahua.txt數(shù)據(jù)放在RData文件夾下
• 讀取本地?cái)?shù)據(jù)
  read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #讀取文件，分隔符為Tab(點(diǎn)tab鍵可以出來seq)，有表頭
  a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把這個(gè)數(shù)據(jù)框賦給一個(gè)變量a
• 設(shè)置行名和列名
  X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個(gè)數(shù)據(jù)框
  colnames(X) #查看列名
  rownames(X)#查看行名,默認(rèn)值的行名就是行號，1.2.3.4...
  colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回?cái)?shù)據(jù)，左上角第一格為空，R會(huì)自動(dòng)補(bǔ)為x,用這個(gè)命令來修改
  X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名
  撤銷嗎: 用剛才的read.table命令重新賦值一遍就可以覆蓋了."變"量看最后一次！）
• 數(shù)據(jù)框的導(dǎo)出
  write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#其中sep = ","是分隔符改為逗號，quote=F表示字符串不加雙引號（默認(rèn)格式帶有雙引號） ，而quote函數(shù)如果為TRUE的話則表示要帶雙引號，如果是FALSE，就像這里的quote=F表示不加雙引
• 變量的保存與重新加載
  保存的格式是RData。
  save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當(dāng)前所有變量
  save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一個(gè)變量
  load("frame1.RData")#再次使用RData時(shí)的加載命令
• 提取元素
  這里的X是指的我用過的一個(gè)變量名，實(shí)際應(yīng)用要懂得替換。剛才讓師姐測試我教程的時(shí)候很擔(dān)憂你們粗暴地復(fù)制我的代碼，最后啥也沒看懂。
  X[x,y]#第x行第y列
  X[x,]#第x行
  X[,y]#第y列（橫著寫）
  X[y] #第y列（豎著寫）
  
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  X[a:b]#第a列到第b列
  X[c(a,b)]#第a列和第b列
  X$列名#也可以提取列（并且支持Tab自動(dòng)補(bǔ)全，不過只能提取一列，優(yōu)秀寫法）
• 直接使用數(shù)據(jù)框中的變量
  比如要取提取列名case和values的為某兩列作散點(diǎn)圖：
  1. 方法1
  c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50)) 這里的paste是拼接字符串的函數(shù)
  plot(c$case,c$values)
  但這里說這里這種方法有個(gè)缺點(diǎn)：數(shù)據(jù)框名a在代碼中重復(fù)出現(xiàn)（此處試驗(yàn)了下沒有）
  2. 方法2（這種方法數(shù)據(jù)框名a在代碼中就不重復(fù)出現(xiàn)了）
  with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并賦值給x,<<的意思是作為全局變量，也就是出了with循環(huán)仍有效。
  })
  什么是with循環(huán)? 如下百度感覺很形象
  
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  全局變量含義？
  函數(shù)內(nèi)部的變量通常為局部變量，可以通過 <<- 賦值，成為全局變量，這樣就可以在其他函數(shù)中被調(diào)用。

三.其他注意TIP

• 腳本窗口使用
  新建腳本，并在里面打代碼/粘貼大神代碼。然后保存到RDATA工作目錄下，打開,注意腳本文件的后綴就是R
  

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• 在哪看變量
  引自生信星球
  

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• 其他潛意識小tip
  來自生信星球的大神總結(jié)
  （1）R的賦值符號不是等號，而是<-
  （2）在Console 控制臺輸入命令，相當(dāng)于Linux的命令行
  （3）R的代碼都是帶括號的，括號必須是英文的。
  （4）顯示工作路徑 getwd()
  　　設(shè)置工作路徑setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
  （5）向量是由元素組成的，元素可以是數(shù)字或者字符串。
  （6）表格在R語言中改名叫數(shù)據(jù)框^_
  （7）別只復(fù)制代碼，要理解其中的命令、函數(shù)的意思。函數(shù)或者命令不會(huì)用時(shí)，除了百度/谷歌搜索以外，用這個(gè)命令查看幫助：?read.table，調(diào)出對應(yīng)的幫助文檔，翻到example部分研究一下。
  （8）數(shù)據(jù)類型(兩重點(diǎn))
  向量（vector）,矩陣（Matrix）,數(shù)組（Array）,數(shù)據(jù)框（Data frame）,List

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