seurat 對象中的 counts 轉(zhuǎn)成稀疏矩陣barcodes.tsv.gz、features.tsv和matrix.mtx.gz三個文件

  • 所使用的R包：DropletUtils

  • 函數(shù)：write10xCounts

BiocManager::install("DropletUtils")    # 安裝 R 包

library(DropletUtils)    # 加載 R 包

# seurat 對象導出 barcodes.tsv.gz、features.tsv 和 matrix.mtx.gz 至 output 文件夾

write10xCounts("output/",seurat_ob[["RNA"]]@counts,version = "3")
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