本系列課程要求大家有一定的R語言基礎(chǔ)，對于完全零基礎(chǔ)的同學(xué)，建議去聽一下師兄的《生信必備技巧之——R語言基礎(chǔ)教程》。本課程將從最基本的繪圖開始講解，深入淺出的帶大家理解和運(yùn)用強(qiáng)大而靈活的ggplot2包。內(nèi)容包括如何利用ggplot2繪制散點(diǎn)圖、線圖、柱狀圖、添加注解、修改坐標(biāo)軸和圖例等。
本次課程所用的配套書籍是：《R Graphic Cookbooks》
除了以上的基本圖形外，師兄還會給大家講解箱線圖、提琴圖、熱圖、火山圖、氣泡圖、桑基圖、PCA圖等各種常用的生信圖形的繪制，還不趕緊加入收藏夾，跟著師兄慢慢學(xué)起來吧！
第一章：快速探索數(shù)據(jù)
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散點(diǎn)圖：
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最簡單的函數(shù)：plot(x, y)
plot(mtcars$wt,mtcars$mpg)
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01.png
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使用qplot
library(ggplot2) qplot(mtcars$wt,mtcars$mpg) qplot(wt,mpg,data = mtcars) # 如果變量x和y都來自于同一個(gè)數(shù)據(jù)框，還可以這樣寫； -
使用ggplot2
ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg)) + geom_point()
02.png
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折線、曲線圖：
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同樣可以用plot來畫：
# plot中type參數(shù)可以指定繪圖的類型：如："l"就是指折、曲線圖 plot(pressure$temperature,pressure$pressure,type = "l") points(pressure$temperature,pressure$pressure) lines(pressure$temperature,pressure$pressure/2, col = "red") points(pressure$temperature,pressure$pressure/2, col = "red")
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03.png
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使用qplot
library(ggplot2) qplot(pressure$temperature,pressure$pressure,geom = "line") qplot(temperature,pressure,data = pressure, geom = "line") # 如果變量x和y都來自于同一個(gè)數(shù)據(jù)框，還可以這樣寫； -
使用ggplot2
ggplot(pressure, aes(x=temperature, y=pressure)) + geom_line() + geom_point()
04.png
