一、Linux介紹
1、linux是一個操作系統(tǒng)
2、應用場景：主要是服務器（supercomputer）
3、界面：命令行，而非圖形界面
4、目錄結(jié)構(gòu)：每個用戶最高訪問宿主目錄，宿主目錄在home目錄下
二、生信為什么需要linux
組學數(shù)據(jù)分析包括：
1、上游分析（linux）：原始數(shù)據(jù)獲取和處理，計算量大，服務器上進行。
2、下游分析（R語言）：差異分析、富集分析、可視化等。
三、Linux使用
1、安裝和登錄
1、安裝xshell軟件，并且登錄服務器。
2、登錄成功后可以輸入命令pwd查看，時間久了會掉線
2、linux常用命令
pwd 顯示當前路徑
mkdir 創(chuàng)建空目錄
ls 顯示列表(不管是目錄還是文件)
cd project/ # 進入該文件
cd - # 返回剛才的目錄
cd ~ # 返回加目錄
cd ../ # 返回上級目錄
3、linux升級命令
vi # 新建腳本或者文本文檔（文本編輯器）
vi hello_world.txt
1）按”Insert“按鈕，進入可編輯模式
2）編輯文檔
3）按”Esc“退出編輯模式
4）左下角輸入:x，即可自動保存并退出
5）通過ls 查看新建文檔
cat hello_world.txt #查看并直接將文本的全部內(nèi)容輸出到屏幕
head -n 3 hello_world.txt # 太長文檔只看前10行
cp hello_world.txt new_file.txt # 復制file1，命名為file2
cp -r tmp tmp2 # 復制文件夾tmp，命名為tmp2
mv file 路徑 # 移動file到某路徑下
mv new_file.txt ../
mv file1 file2是將file1重命名為file2
mv new_file.txt douhua.txt
rm # 刪除目錄
rm -r #刪除目錄
