中國計算機輔助藥物現(xiàn)狀

最近在查相關(guān)的計算機輔助藥物設(shè)計的相關(guān)資料,做下總結(jié)。
目前國內(nèi)的計算機輔助藥物設(shè)計中心:上海藥物化學(xué)所,北京大學(xué),中國藥科大學(xué)。(這里指的是CADD中心,如果單獨的只是分子對接中心,則不考慮在內(nèi),例:http://www.bcc.ac.cn/cn/jsyw/jsyw_sy.html
注:以下序號不代表排名
時間:20190304
1:上海藥物所-蔣華良課題組
蔣華良長期致力藥學(xué)基礎(chǔ)研究和新藥研發(fā),他通過生物學(xué)、化學(xué)和計算科學(xué)等多學(xué)科的交叉,開展原創(chuàng)藥物研究新策略與新方法、先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化、藥物靶標(biāo)調(diào)控機制等研究。他發(fā)展了一系列靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)和藥物設(shè)計新方法,被國際同行高度重視和應(yīng)用,推動我國該領(lǐng)域研究水平進入國際前沿。他發(fā)展了能預(yù)測化合物藥效的理論計算方法,解決了藥物設(shè)計領(lǐng)域的重大難題。他針對多種重要靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)了數(shù)十個新結(jié)構(gòu)類型的先導(dǎo)化合物,其中1個抗勃起功能障礙候選藥物已進入臨床試驗,5個抗2型糖尿病等疾病的候選新藥正處于臨床前研究。迄今他在國際學(xué)刊上發(fā)表了通訊作者論文200余篇、綜述10篇;合編專著16本,譯著2本;被他引6000余次。申請專利115項,已授權(quán)35項,實現(xiàn)成果轉(zhuǎn)讓3項(合同金額達1.8億)。
蔣華良院士是相比較來說,綜合實力最強的一位。不管是計算機輔助藥物設(shè)計還是成果轉(zhuǎn)化,其申請專利70余項,絕大多數(shù)是關(guān)于藥物制備以及研發(fā)。發(fā)表著作15本,大部分是有關(guān)于生物信息,化學(xué)信息,生物模擬。在其藥物研發(fā)的過程中,為主要研究方向為藥物分子設(shè)計。近年主要開展離子通道、酪氨酸激酶、脂質(zhì)代謝相關(guān)通路、新型抗菌(病毒)靶標(biāo)及表觀遺傳學(xué)相關(guān)重要蛋白質(zhì)的靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)、分子動力學(xué)模擬、計算機輔助藥物設(shè)計,藥物設(shè)計方法、ADME/T預(yù)測方法和生物信息學(xué)研究。
2:北京大學(xué)-來魯華課題組
來魯華教授,主要應(yīng)用物理化學(xué)、計算和實驗生物化學(xué)以藥物化學(xué)方法研究蛋白質(zhì)及其參與的生命過程。試圖揭示蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系,探討生物分子作用機理,開展蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能設(shè)計,進行基于結(jié)構(gòu)和基于系統(tǒng)的藥物設(shè)計方法與應(yīng)用研究。發(fā)展新的計算設(shè)計方法與程序,模擬生物分子機制及系統(tǒng)規(guī)律;采用理論計算與實驗密切結(jié)合的方法定量研究生物分子作用機制并進行蛋白質(zhì)、藥物和生物系統(tǒng)設(shè)計。
目前CADD所用的軟件已經(jīng)是被國外包圍的狀況下,來魯華教授對于CADD軟件的開發(fā)走在了中國的前列,實驗室自主開發(fā)的軟件18項,在軟件開發(fā)這方面相比較來說是做的最好的。
3:中國藥科大學(xué)-陸濤研究組
江蘇省新藥篩選中心依托中國藥科大學(xué)建設(shè),其余詳細資料,待補充。

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