天京事變使太平天國喪失了楊秀清、韋昌輝、秦日綱、陳承镕等一批領(lǐng)導(dǎo)層的核心人物與優(yōu)秀將領(lǐng)，而且連累兩、三萬兩廣太平軍老將士及其眷屬失去性命。其中多數(shù)人參加過金田起義，是久經(jīng)沙場、驍勇善戰(zhàn)且對天國忠心耿耿的太平軍精銳，對太平天國功不可沒，是太平軍的中流砥柱。這幫人沒有死在對清軍作戰(zhàn)的血肉戰(zhàn)場上，卻無辜枉死在殘酷的內(nèi)訌中。
天京事變在天國內(nèi)部造成了嚴(yán)重的信任危機，使人心渙散，也使天國不能全力以赴對付清軍的進剿。事變后，太平軍軍心不穩(wěn)，軍中流傳一首嘲歌曰：“天父殺天兄，終歸一場空，打起包袱回家轉(zhuǎn)，還是做苦工?！辈簧俟俦_始懷疑并反感洪秀全等極力鼓吹的拜上帝教，從而導(dǎo)致信仰崩塌，暗中相率逃亡或降清者也越來越多，使太平天國難以避免地走向衰敗，這種衰敗頹廢的氣象在當(dāng)時的戰(zhàn)場上很快顯示出來。
洪楊內(nèi)訌后，太平軍士氣日衰，指揮分散，攻擊力明顯減弱。清朝官吏把這一切全看在眼里，曾國藩更是暗暗竊喜，他在寫給清廷的奏折中說：“自洪楊內(nèi)亂以來，賊中大綱紊亂?！?/p>
后來，代替楊秀清主持天朝軍政的翼王石達(dá)開因飽受洪秀全猜忌、掣肘，憤而離京出走，有五、六萬人隨他出京，導(dǎo)致天京城內(nèi)防守空虛。隨后石達(dá)開又從安慶把對清斗爭前線的二十余萬浙、贛精銳太平軍帶走，游離于天朝在外單獨征戰(zhàn)。
清廷感到機會終于來了，于是調(diào)兵遣將，清軍開始全面反撲，環(huán)攻陷入低潮的太平天國。咸豐七年（1857年）6月11日，江蘇溧水被清軍攻陷，7月16日，句容也告失守。
曾氏湘軍趁太平天國內(nèi)訌，太平軍被迫撤離江西、湖北前線之機，得以休養(yǎng)生息，重振旗鼓，再次成為太平軍的勁敵。
湘軍在江西接連獲勝，相繼收復(fù)了瑞州、宜黃、崇仁、新淦等郡縣。官文、胡林翼率綠營在湖北也取得很大進展，先是收復(fù)了漢陽，陣斃太平天國秋官副丞相鐘廷生，胡林翼收復(fù)武昌、漢口，生俘太平軍檢點古文新等14個將領(lǐng)，武漢三鎮(zhèn)全部收復(fù)。
湘軍又乘勢奪取黃州、興國州、蘄州、蘄水、廣濟等地，短短十余天就橫掃湖北，將太平軍驅(qū)逐出境。接著彭玉麟率水師搗入江西，李續(xù)賓率八千陸師順江而下，長驅(qū)直入，抵達(dá)九江。經(jīng)一系列苦戰(zhàn)，湘軍先后攻取湖口、彭澤，接著曾國荃、李續(xù)賓又費盡九牛二虎之力攻下九江，太平軍悍將林啟容、李興隆及麾下一萬七千余守軍全部玉碎，江防重鎮(zhèn)九江從此易手。
清軍綠營也攻拔下瓜州、鎮(zhèn)江，截斷了天京的糧道......南北都紛紛報捷。和春、張國樑又乘勝在孝陵衛(wèi)建立了一個江南大營，窺視天京。
再說湖北巡撫胡林翼奉旨率軍進援江西，遣李續(xù)賓赴瑞州，文翼赴吉安、臨江。劉長佑、蕭啟江率湘勇進攻臨江，太平軍守衛(wèi)部隊奮力抵抗，久攻不下；曾國荃親自率吉字營開赴吉安，協(xié)助文翼攻城。恰巧離京出走的太平天國翼王石達(dá)開部前鋒也開至吉安，曾國荃聞訊率部主動迎戰(zhàn)，前去攻打石達(dá)開。
