生物數(shù)據(jù)庫介紹——NCBI
NCBI（National Center for Biotechnology Information，美國國家生物技術(shù)信息中心）除了維護(hù)GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫外，還提供數(shù)據(jù)分析和檢索資源。NCBI資源包括Entrez、Entrez編程組件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、BLAST、Pimer-Blast、COBALT、RefSeq、UniGene、HomoloGene、ProtEST、dbMHC、dbSNP、dbVar、Epigenomics、the Genetic Testing Registry、Genome和相關(guān)工具、比對查看器、跟蹤存檔、Sequence Read Archive、BioProject、BioSample、ClinVar、MedGen、HIV-1/人類蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫、Gene Expression Omnibus、Probe、Online Mendelian Inheritance in Animals、the Molecular Modeling Database、the Conserved Domain Database、the Conserved Domain Architecture Retrieval Tool、Biosystem、Protein Clusters and thePubChem suite of small molecule databases，所有這些資源可以在NCBI主頁找到。
Databases
一個提供有關(guān)基因組組裝結(jié)構(gòu)，裝配名稱和其他元數(shù)據(jù)，統(tǒng)計報告以及基因組序列數(shù)據(jù)鏈接等信息的數(shù)據(jù)庫。
一個有關(guān)培養(yǎng)物、動植物樣本和其他自然樣本的精選元數(shù)據(jù)集。 記錄顯示樣本狀態(tài)，有關(guān)館藏的機(jī)構(gòu)的信息，以及NCBI中相關(guān)數(shù)據(jù)鏈接。
BioProject (formerly Genome Project)
基因組學(xué)，功能基因組學(xué)和遺傳學(xué)研究的集合以及其結(jié)果數(shù)據(jù)集的鏈接。 此資源描述項目范圍，材料和目標(biāo)，并提供一種機(jī)制來檢索由于注釋不一致，多個獨立提交以及通常存儲在不同數(shù)據(jù)庫中的各種數(shù)據(jù)類型的不同性質(zhì)而經(jīng)常難以找到的數(shù)據(jù)集。
BioSample數(shù)據(jù)庫包含實驗測定中使用的生物來源材料的描述。
根據(jù)生物關(guān)系對生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，小分子和序列數(shù)據(jù)進(jìn)行分組的數(shù)據(jù)庫。
可直接搜索或從其他NCBI數(shù)據(jù)庫中的鏈接數(shù)據(jù)搜索的生物醫(yī)學(xué)書籍集合。 該系列包括生物醫(yī)學(xué)、其他科學(xué)主題書，GeneReviews等遺傳資源和NCBI幫助手冊。
儲存人類變異與觀察到的健康狀況之間關(guān)系的記錄以及支持證據(jù)的數(shù)據(jù)庫?？梢酝ㄟ^記錄上的超鏈接訪問NIH Genetic Testing Registry (GTR),MedGen,Gene,OMIM,PubMed相關(guān)信息。
世界各地公開和私人支持的臨床研究的登記和結(jié)果數(shù)據(jù)庫。
Computational Resources from NCBI's Structure Group
一個由對NCBI計算生物學(xué)分會（CBB）結(jié)構(gòu)組開發(fā)的資源的訪問和鏈接的集中頁面。 這些資源包括幫助研究大分子結(jié)構(gòu)，保守結(jié)構(gòu)域和蛋白質(zhì)分類，小分子及其生物活性，以及生物途徑和系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫和工具。
人類和小鼠一致注釋和高質(zhì)量的核心蛋白質(zhì)編碼區(qū)域。
Conserved Domain Database (CDD)
CDD是一種蛋白質(zhì)注釋資源，由一系列經(jīng)過充分注釋的古代結(jié)構(gòu)域和全長蛋白質(zhì)序列比對模型組成。
Database of Genomic Structural Variation (dbVar)
dbVar數(shù)據(jù)庫儲存了大規(guī)?；蚪M變異相關(guān)的信息，包括大插入，缺失，易位和倒位。 除了分類突變之外，dbVar還存儲已定義突變與表型信息的關(guān)聯(lián)。
Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP)
儲存基因型和表型相互作用研究結(jié)果和描述的數(shù)據(jù)庫，這些研究包括全基因組關(guān)聯(lián)（GWAS）、醫(yī)學(xué)重測序、分子診斷，以及基因型與非臨床性狀之間的關(guān)聯(lián)。
Database of Short Genetic Variations (dbSNP)
數(shù)據(jù)庫包含單核苷酸突變、微衛(wèi)星和小規(guī)模插入和缺失信息。
NIH基因序列數(shù)據(jù)庫，是所有公開可用DNA序列的注釋集合。NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫和日本DNA數(shù)據(jù)庫（DDBJ），歐洲分子生物學(xué)實驗室（EMBL）每天交換數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)實時跟新。 GenBank由幾個部分組成，大部分序列可以通過Nucleotide數(shù)據(jù)庫訪問。 例外的是EST和GSS分區(qū)，分別通過Nucleotide? EST和Nucleotide GSS數(shù)據(jù)庫訪問。
一個可搜索的基因數(shù)據(jù)庫，專注于已經(jīng)完全測序的基因組，并且有一個活躍的研究團(tuán)體來提供基因特異性數(shù)據(jù)?；蛐畔ā⑷旧w定位、基因產(chǎn)物及其屬性（例如，蛋白質(zhì)相互作用）、相關(guān)標(biāo)記、表型、相互作用、引文鏈接、序列、突變詳情、圖譜、表達(dá)報告、同源物、蛋白結(jié)構(gòu)域內(nèi)容和外部數(shù)據(jù)庫鏈接。
Gene Expression Omnibus (GEO) Database
公共功能基因組數(shù)據(jù)庫，支持符合MIAME標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)提交。接受基于芯片和測序數(shù)據(jù)，并提供工具以幫助用戶查詢和下載實驗數(shù)據(jù)并研究基因表達(dá)譜。
Gene Expression Omnibus (GEO) Datasets
存儲從Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫組裝的基因表達(dá)和分子豐度數(shù)據(jù)集。數(shù)據(jù)集每個記錄包含其他資源，包括集群工具和差異表達(dá)式查詢。
Gene Expression Omnibus (GEO) Profiles
存儲從Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫組裝的單個基因表達(dá)和分子豐度配置文件。 基于基因注釋或預(yù)先計算的輪廓特征搜索感興趣的特定配置。
NCBI Bookshelf上專家撰寫的同行評審疾病描述集，將基因檢測應(yīng)用于具有特定遺傳病癥的患者和家屬的診斷，管理和遺傳咨詢。
選定遺傳疾病的信息摘要，討論潛在的突變和臨床特征，以及相關(guān)數(shù)據(jù)庫和組織的鏈接。
Genetic Testing Registry (GTR)
基因測試和實驗室記錄，包括測量的詳細(xì)信息，如測量和分析以及臨床有效性。 GTR也是遺傳條件信息的紐帶，并提供與各種資源的特定背景相關(guān)的鏈接，包括實踐指南，已發(fā)表的文獻(xiàn)和遺傳數(shù)據(jù)/信息。 GTR的最初范圍包括孟德爾疾病的單基因測試，以及陣列，小組和藥物遺傳學(xué)測試。
包含來自1000多種生物的全基因組的序列和比對數(shù)據(jù)。 基因組代表完全測序的生物和正在進(jìn)行測序的生物， 三個主要領(lǐng)域（細(xì)菌，古細(xì)菌和真核生物），以及許多病毒，噬菌體，類病毒，質(zhì)粒和細(xì)胞器。
Genome Reference Consortium (GRC)
基因組參考聯(lián)盟（GRC）負(fù)責(zé)人和小鼠參考基因組，成員包括華盛頓大學(xué)的基因組中心，Wellcome Trust Sanger研究所，歐洲生物信息學(xué)研究所（EBI）和國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）。 GRC致力于糾正錯誤代表的位點并完善剩余的裝配間隙。 此外，GRC尋求為復(fù)雜或結(jié)構(gòu)變異的基因組位點提供替代組裝。 在GRC網(wǎng)站（http://www.genomereference.org）上，公眾可以查看目前正在審查的基因組區(qū)域，報告基因組相關(guān)問題并聯(lián)系GRC。
HIV-1, Human Protein Interaction Database
已知HIV-1蛋白與人宿主蛋白相互作用的數(shù)據(jù)庫。 它提供了已發(fā)表的蛋白質(zhì)相互作用報告的注釋書目，并附有相應(yīng)PubMed記錄和序列數(shù)據(jù)的鏈接。
描述在GenBank和RefSeq中注釋的編碼區(qū)中鑒定的蛋白質(zhì)，以及SwissProt和PDB蛋白質(zhì)序列的綜合記錄集合。 該資源允許研究人員獲得更有針對性的搜索結(jié)果并快速識別感興趣的蛋白質(zhì)。
來自NIAID流感基因組測序項目和GenBank的數(shù)據(jù)集合，它提供了流感序列分析，注釋和GenBank提交工具。 該資源還包含其他流感序列資源的鏈接，以及有關(guān)流感病毒的出版物和一般信息。
NLM目錄數(shù)據(jù)庫的子數(shù)據(jù)庫，提供NCBI數(shù)據(jù)庫記錄中引用的期刊信息，包括PubMed摘要。支持期刊標(biāo)題，MEDLINE或ISO縮寫，ISSN或NLM目錄ID搜索此數(shù)據(jù)庫。
MeSH（醫(yī)學(xué)主題詞）是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館用于索引MEDLINE / PubMed文章的受控詞匯表。MeSH術(shù)語提供了一種一致的方法來檢索可能對相同概念使用不同術(shù)語的信息。
醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)信息門戶，MedGen包含來自多個來源的術(shù)語列表，并將它們組織成概念分組和層次分組。還提供了NIH Genetic Testing Registry (GTR),ClinVar,Gene,OMIM,PubMed和其它來源中的相關(guān)鏈接信息。
NCBI C++工具包綜合手冊，包括其設(shè)計和開發(fā)框架，C++庫參考，軟件示例和演示，常見問題解答和發(fā)行說明。該手冊可在線搜索，可以下載為一系列PDF文檔。
提供教程和培訓(xùn)材料的鏈接，包括PowerPoint幻燈片和打印講義。
作為NCBI手冊的一部分，本詞匯表包含NCBI工具和首字母縮寫詞，生物信息學(xué)術(shù)語和數(shù)據(jù)表示格式的描述。
有關(guān)NCBI數(shù)據(jù)庫和軟件的文章集合。，專為新手用戶設(shè)計，每篇文章都提供了資源及其設(shè)計的一般概述，以及搜索和使用可用分析工具的提示。所有文章都可以在線搜索并以PDF格式下載;該手冊可以通過NCBI Bookshelf訪問。
通過NCBI Bookshelf訪問，幫助手冊包含許多NCBI資源的文檔，包括PubMed，PubMed Central，Entrez系統(tǒng)，Gene，SNP和LinkOut。所有章節(jié)均可以PDF格式下載。
NCBI Pathogen Detection Project
一個關(guān)于收集和分析源自食品，環(huán)境和患者分離物的細(xì)菌病原體基因組序列的項目。目前，自動化分析集群并識別主要由公共衛(wèi)生實驗室提供的序列，以協(xié)助調(diào)查食源性疾病爆發(fā)并發(fā)現(xiàn)潛在的食物污染源。
National Library of Medicine (NLM) Catalog
圖書館館藏中所有期刊，書籍，視聽，計算機(jī)軟件，電子資源和其他資料的書目數(shù)據(jù)。
來自多個來源的核苷酸序列的集合，包括GenBank，RefSeq，第三方注釋（TPA）數(shù)據(jù)庫和PDB。
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)
人類基因和遺傳疾病的數(shù)據(jù)庫。NCBI維護(hù)當(dāng)前內(nèi)容并繼續(xù)支持其與其他NCBI數(shù)據(jù)庫的搜索和集成。但是，OMIM現(xiàn)在在omim.org上有一個新主頁，用戶可以直接訪問該站點進(jìn)行全面顯示。
來自比較研究的相關(guān)DNA序列的數(shù)據(jù)庫：系統(tǒng)發(fā)育，種群，環(huán)境以及在較小程度上的突變。數(shù)據(jù)庫中的每個記錄都是一組DNA序列。例如，群體集提供有關(guān)生物體內(nèi)遺傳變異的信息，而系統(tǒng)發(fā)育集可以包含從幾個相關(guān)生物獲得的單個基因的序列及其比對。
用于各種生物醫(yī)學(xué)研究應(yīng)用的核酸試劑數(shù)據(jù)庫，有關(guān)試劑比例、探針有效性和序列相似性等信息。
相關(guān)蛋白質(zhì)序列（簇）的集合，由完整的原核和細(xì)胞器質(zhì)粒和基因組編碼的參考序列蛋白組成。 該數(shù)據(jù)庫提供對注釋信息，出版物，域，結(jié)構(gòu)，外部鏈接和分析工具的輕松訪問。
包含來自各種來源的蛋白質(zhì)序列記錄的數(shù)據(jù)庫，包括GenPept，RefSeq，Swiss-Prot，PIR，PRF和PDB。
由沉積的生物活性數(shù)據(jù)和用于篩選PubChem物質(zhì)數(shù)據(jù)庫中包含的化學(xué)物質(zhì)的生物活性測定的描述組成，包括篩選程序特有的條件和讀數(shù)（生物活性水平）的描述。
包含可以使用名稱，同義詞或關(guān)鍵詞搜索的，經(jīng)過驗證的唯一化學(xué)結(jié)構(gòu)（小分子）。如果不同的研究者提供相同的結(jié)構(gòu)，則復(fù)合記錄可以鏈接到多個PubChem物質(zhì)記錄。這些化合物記錄反映了用于描述PubChem物質(zhì)中物質(zhì)的經(jīng)過驗證的化學(xué)描述信息。
PubChem物質(zhì)記錄包含提交人提交給PubChem的物質(zhì)信息，這包括提交的任何化學(xué)結(jié)構(gòu)信息，以及化學(xué)名稱，評論和提交人網(wǎng)站的鏈接。
MEDLINE和其他生命科學(xué)期刊的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)引文和摘要數(shù)據(jù)庫。
全文生物醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)期刊文獻(xiàn)，包括臨床醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生。
人類基因特異性參考基因組序列的集合。
由NCBI產(chǎn)生的主持的，非冗余的基因組DNA，轉(zhuǎn)錄物（RNA）和蛋白質(zhì)序列的集合。
專門用于支持逆轉(zhuǎn)錄病毒研究的資源數(shù)據(jù)庫
SARS冠狀病毒（CoV）的數(shù)據(jù)摘要，包括與最新序列數(shù)據(jù)和出版物的鏈接，與其他SARS相關(guān)資源的鏈接，以及來自各種分離株的基因組序列的預(yù)先計算的比對。
序列讀取存檔（SRA）存儲來自下一代測序平臺的測序數(shù)據(jù)，包括Roche 454GSSystem?，Illumina GenomeAnalyzer?，Life Technologies ABSOLiDSystem?，HelicosBiosciencesHeliscope?，CompleteGenomics?和PacificBiosciencesSMRT?
Structure (Molecular Modeling Database)
包含源自蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的大分子3D結(jié)構(gòu)，以及用于可視化和比較分析的工具。
包含NCBI數(shù)據(jù)庫中具有分子數(shù)據(jù)的160,000多種生物的名稱和系統(tǒng)發(fā)育譜系。
Third Party Annotation (TPA) Database
包含從GenBank中現(xiàn)有主序列數(shù)據(jù)構(gòu)建的序列的數(shù)據(jù)庫。
用于各種大規(guī)模測序項目的單次讀取的DNA序列色譜圖（跡線），堿基調(diào)用和質(zhì)量估計的存儲庫。
廣泛的資源，包括病毒生物學(xué)的簡述、Entrez Genome中病毒基因組序列的鏈接，以及有關(guān)病毒參考序列的信息、數(shù)千個病毒基因組的參考序列的集合。
將流感病毒資源擴(kuò)展到其他生物體，提供下載所選病毒序列集的界面，分析工具，包括病毒特異性BLAST頁面和基因組注釋管道。
Tools
一個交互式圖形查看器，允許用戶研究由1000 Genomes Project生成的突變、基因型和支持證據(jù)（例如，比對的序列read數(shù)）。
該工具允許用戶通過比較它們的結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)，預(yù)測由突變引起的蛋白質(zhì)序列變化，查看常見的取代，以及瀏覽保守結(jié)構(gòu)域中給定殘基的功能來探索氨基酸的特征。
將跟蹤存檔中找到的原始序列信息與公開可用的序列存儲庫（GenBank / EMBL / DDBJ）中的裝配信息相鏈接。Assembly Viewer允許用戶查看多序列比對以及實際序列色譜圖。
對選定的完整真核和原核基因組中的相似序列進(jìn)行BLAST搜索。
對RefSeqGene/LRG集中的基因組序列進(jìn)行BLAST搜索。
此頁面鏈接到許多與BLAST相關(guān)的教程和指南，包括BLAST算法的選擇指南，BLAST輸出格式的說明，獨立BLAST參數(shù)的說明，在本地機(jī)器上設(shè)置獨立BLAST的說明以及使用BLAST URL API。
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)
找到生物序列之間的局部相似性區(qū)域，該程序?qū)⒑塑账峄虻鞍踪|(zhì)序列與序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較，并計算匹配的統(tǒng)計顯著性。 BLAST可用于推斷序列之間的功能和進(jìn)化關(guān)系，以及幫助鑒定基因家族的成員。
允許你提交Nucleotide、Protein或其他Entrez數(shù)據(jù)庫中的GI、登錄號或其他唯一標(biāo)識符的文件，從許多Entrez數(shù)據(jù)庫中檢索記錄。
一個用于分類蛋白質(zhì)序列和調(diào)查其進(jìn)化關(guān)系的應(yīng)用程序。CDTree可以導(dǎo)入，分析和更新現(xiàn)有的保守域（CDD）記錄和層次結(jié)構(gòu)，還允許用戶創(chuàng)建自己的記錄和層次結(jié)構(gòu)。CDTree與Entrez CDD和Cn3D緊密集成，允許用戶創(chuàng)建和更新蛋白質(zhì)域?qū)R。
COBALT是一種蛋白質(zhì)多序列比對工具，使用RPS-BLAST，BLASTP和PHI-BLAST找到從保守結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫，蛋白質(zhì)基序數(shù)據(jù)庫和序列相似性衍生的成對約束的集合。
用于從NCBI的Entrez檢索服務(wù)查看三維結(jié)構(gòu)的獨立應(yīng)用程序。
作為NCBI Bookshelf的一部分，Coffee Break結(jié)合了近期生物醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)的報告和NCBI工具的使用。每份報告都包含互動教程，展示NCBI生物信息學(xué)工具如何用作研究過程的一部分。
Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART)
顯示構(gòu)成給定蛋白質(zhì)序列的功能域。它列出了具有相似結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)，并且可以檢索含有特定結(jié)構(gòu)域組合的蛋白質(zhì)。
Conserved Domain Search Service (CD Search)
鑒定蛋白質(zhì)序列中存在的保守結(jié)構(gòu)域。
在常規(guī)Web查詢界面之外提供對NCBI Entrez系統(tǒng)內(nèi)數(shù)據(jù)訪問的工具。
允許用戶使用在線表單構(gòu)建E-utility分析流程，然后生成Perl腳本以執(zhí)行分析流程的工具。
Gene Expression Omnibus (GEO) BLAST
用于將查詢序列（核苷酸或蛋白質(zhì)）與包含在GEO數(shù)據(jù)庫中的微陣列或SAGE平臺上的GenBank序列對齊的工具。
在表和分類樹中顯示分類法數(shù)據(jù)庫中生物的遺傳密碼。
該工具將核苷酸或蛋白質(zhì)序列與基因組序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較，并使用基本局部比對搜索工具（BLAST）算法計算匹配的統(tǒng)計顯著性。
Genome Data Viewer (GDV)? ? ? ? ?
用于真核RefSeq基因組裝配的交互式導(dǎo)航的基因組瀏覽器，其具有對基因，表達(dá)，變異和其他注釋的全面檢查。（RefSeq數(shù)據(jù)庫，即RefSeq參考序列數(shù)據(jù)庫，美國國家生物信息技術(shù)中心（NCBI）提供的具有生物意義上的非冗余non-redundent的基因和蛋白質(zhì)序列。）
Genome Decoration Page? ? ? ? ?
一種可幫助生成關(guān)于基因組組裝注釋和序列名稱的期刊質(zhì)量數(shù)字工具。
Genome Remapping Service? ? ? ? ?
NCBI的重映射工具允許用戶映射注釋數(shù)據(jù)并將特征的位置從一個基因組版本轉(zhuǎn)換為另一個，或通過堿基分析將RefSeqGene序列轉(zhuǎn)換為RefSeqGene序列。
用于查看和分析序列數(shù)據(jù)的集成應(yīng)用程序。
一種允許第三方直接從PubMed和其他Entrez數(shù)據(jù)庫記錄鏈接到Entrez系統(tǒng)之外的相關(guān)Web可訪問資源服務(wù)。
Map Viewer（被genome data viewer取代了）
為生物的子集提供比對和組裝序列的特殊瀏覽功能。
Multiple Sequence Alignment Viewer
一種交互式Web應(yīng)用程序，使用戶能夠可視化由數(shù)據(jù)庫搜索結(jié)果或其他軟件應(yīng)用程序創(chuàng)建的多個對齊。
提供有關(guān)新的和更新的資源以及NCBI研究和開發(fā)項目的信息。
NCBI用于生成分子生物學(xué)便攜式模塊化軟件的一套軟件和數(shù)據(jù)交換規(guī)范。
一個公共領(lǐng)域質(zhì)量保證軟件包，有助于根據(jù)實驗室特定的協(xié)議評估多重短串聯(lián)重復(fù)（STR）DNA譜。
Open Reading Frame Finder (ORF Finder)
一種圖形分析工具，用于查找用戶序列中或已存在于數(shù)據(jù)庫中的序列中的所有開放閱讀框。
允許用戶從CDD記錄或位置特異性迭代（PSI）-BLAST蛋白質(zhì)搜索中顯示，排序，子集和下載位置特異性評分矩陣（PSSM）。
Phenotype-Genotype Integrator (PheGenI)
支持通過表型，染色體位置，基因和SNP標(biāo)識符查詢?nèi)祟惐硇?基因型關(guān)系。
Primer-BLAST工具使用Primer3設(shè)計序列模板的PCR引物。然后通過針對用戶指定數(shù)據(jù)庫的BLAST搜索自動分析潛在產(chǎn)品，以檢查對目標(biāo)的特異性。
用于計算蛋白質(zhì)與基因組核苷酸序列的比對的實用程序。
PubChem Power User Gateway (PUG)? ? ? ? ?
PUG通過編程接口提供對PubChem服務(wù)的訪問。
PubChem Standardization Service
PubChem術(shù)語中的標(biāo)準(zhǔn)化是以與貢獻(xiàn)者原始結(jié)構(gòu)創(chuàng)建PubChem化合物記錄相同的方式處理化學(xué)結(jié)構(gòu)。
PubChem Structure Search? ? ? ? ?
PubChem結(jié)構(gòu)搜索允許通過化學(xué)結(jié)構(gòu)或化學(xué)結(jié)構(gòu)模式查詢PubChem化合物數(shù)據(jù)庫。
專門的PubMed搜索表，面向臨床醫(yī)生和醫(yī)療服務(wù)研究人員。該頁面簡化了臨床研究類別的搜索，查找系統(tǒng)評價和搜索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)文獻(xiàn)。
PubMed搜索和鏈接的一系列Web和Flash教程，使用MeSH和其他PubMed服務(wù)在MyNCBI中保存搜索。
相關(guān)結(jié)構(gòu)工具允許用戶從分子建模數(shù)據(jù)庫（MMDB）中查找與查詢蛋白質(zhì)序列相似的3D結(jié)構(gòu)。
SNP Database Specialized Search Tools
有多種工具可用于搜索SNP數(shù)據(jù)庫，允許使用BLAST通過基因型，方法，群體，提交者，標(biāo)記和序列相似性進(jìn)行搜索。
Sequence Cytogenetic Conversion Service
一種在線工具，可轉(zhuǎn)換人類，大鼠，小鼠和果蠅基因組裝配的序列和細(xì)胞遺傳學(xué)坐標(biāo)。
提供核苷酸或蛋白質(zhì)序列的可配置圖形顯示以及已在該序列上注釋的特征。
用于計算cDNA到基因組序列比對的實用程序。
支持使用部分分類名稱，通用名稱，通配符和語音相似的名稱搜索分類樹。
為選定的一組生物生成分類樹。用戶可以上傳分類標(biāo)識或名稱的文件，也可以直接輸入名稱或ID。
顯示給定排名和包含日期的數(shù)據(jù)庫中的分類節(jié)點數(shù)。
顯示一組分類節(jié)點或ID的當(dāng)前狀態(tài)。
用于創(chuàng)建和顯示系統(tǒng)發(fā)育樹數(shù)據(jù)的工具。Tree Viewer可以分析您自己的序列數(shù)據(jù)，將可打印的矢量圖像生成為PDF，并且可以嵌入到網(wǎng)頁中。
用于搜索和查看dbSNP，dbVar和ClinVar數(shù)據(jù)庫中列出的基因組變異的基因組瀏覽器。
一種用于快速鑒定可能是載體來源的核酸序列區(qū)段的系統(tǒng)。
Vector Alignment Search Tool (VAST)
一種識別相似蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的計算機(jī)算法。
該工具有助于識別病毒序列的基因型。
