單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組繪圖視頻教程

我在B站發(fā)布了“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組繪圖”系列視頻教程,一共分了9集,共計57分鐘,適合入門single cell和想進(jìn)階的小伙伴。

1. 數(shù)據(jù)預(yù)處理and腫瘤樣本去不去批次

(這個圖是沒有去批次的)

2. tsne或者umap降維圖的一般畫法
3. 左下角的坐標(biāo)軸怎么畫

其實是用線段代替了坐標(biāo)軸

4. 散點圖加等高線加二維密度圖

nature那篇的繪圖還有個大圓圈,最后把它倆組合起來就可以了,后期全靠AI

5. 計算基因集分?jǐn)?shù)_投影圖
6. 熱圖展示marker基因
7. 氣泡圖展示marker基因
8. 堆疊小提琴圖展示marker基因
9. 條形圖展示細(xì)胞亞群占比and質(zhì)控圖

共重號回復(fù)20211114有代碼和示例數(shù)據(jù)的獲取方式
因水平有限,有錯誤的地方,歡迎批評指正!

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