前面簡單給大家介紹過
有些小伙伴反映,僅僅看文字版本還是不知道怎么實際動手操作。為了讓大家理論結合實際,能真正動手分析自己的數(shù)據,小編特地錄制了一門視頻課程。

本系列課程一共包含三門課程,一共24期視頻。
第一部分:GEO數(shù)據庫介紹,數(shù)據檢索,差異表達分析,boxplot繪制,主成分分析(PCA),火山圖繪制
第一期:GEO數(shù)據庫介紹,如何檢索自己感興趣的數(shù)據
第二期:GEO2R工具和使用方法介紹
第三期:GEO2R結果圖和表解讀
第四期:mRNA芯片表達譜數(shù)據及探針注釋文件下載
第五期:讀入mRNA芯片表達譜數(shù)據及探針注釋文件到R中
第六期:mRNA差異表達分析
第七期:繪制mRNA芯片表達譜的boxplot(箱型圖)
第八期:mRNA芯片表達譜主成分分析(PCA),火山圖繪制
第九期:miRNA芯片表達譜數(shù)據下載及差異表達分析
第十期:繪制miRNA芯片表達譜的boxplot,主成分分析和火山圖繪制
第十一期:windows下如何安裝R和Rstudio軟件
第十二期:mac下如何安裝R和Rstudio軟件
第二部分:GO和KEGG富集分析
第一期:GO介紹,GO富集分析結果解讀,4種風格GO富集分析圖如何看
第二期:R做GO富集分析
第三期:R繪制四種風格的GO富集分析圖
第四期:KEGG介紹,R做KEGG富集分析
第五期:R繪制KEGG富集分析圖,通路圖(無Fold change)
第六期:R做KEGG富集分析,繪制KEGG富集分析圖,通路圖(有Fold change,通過差異表達分析獲得??梢詤⒖糡CGA數(shù)據分析和GEO數(shù)據分析課程)
第七期:windows下如何安裝R和Rstudio軟件
第八期:mac下如何安裝R和Rstudio軟件
第三部分:理論結合實踐,詳細講解經常在科研文章中看到的火山圖該如何來理解。利用R的EnhancedVolcano包實際動手繪制火山圖,詳細講解EnhancedVolcano常用參數(shù)的使用方法,繪制出各種酷炫的火山圖。
第一期:詳細講解火山圖該如何理解
第二期:繪制火山圖時如何修改火山圖主標題,副標題,腳注
第三期:繪制火山圖時如何修改火山圖X軸范圍,F(xiàn)old Change閾值,P值閾值,修改點大小,顏色(自定義顏色)和標簽大小,如何隱藏標簽
第四期:繪制火山圖時如何修改火山圖中點的形狀(自定義形狀),修改圖注內容,風格和位置,用箭頭標注點的名字,只標注感興趣的點,用帶方框的標簽來標注點的名字