安裝和加載R包

1.鏡像設(shè)置

初級模式
CRAN的鏡像，（不能下載Bioconductor的包）

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升級模式
自定義CRAN和Bioconductor的下載鏡像

# options函數(shù)就是設(shè)置R運行過程中的一些選項設(shè)置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對應(yīng)清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對應(yīng)中科大源
# 當(dāng)然可以換成其他地區(qū)的鏡像

下次打開Rstudio:下載Bioconductor還是會回到官方鏡像，可以查詢options()$BioC_mirror試試，
如果是國內(nèi)鏡像，就不用管了；
如果發(fā)現(xiàn)需要再重新運行一遍代碼進(jìn)行設(shè)置，那么就需要高級模式

高級模式
不用每次運行一遍鏡像設(shè)置------R的配置文件 .Rprofile
Rstudio最重要的兩個配置文件：在剛開始運行Rstudio的時候，程序會查看許多配置內(nèi)容，
1.Renviron，它是為了設(shè)置R的環(huán)境變量（這里先不說它）；
2.Rprofile代碼文件，如果啟動時找到這個文件，那么就替我們先運行一遍（這個過程就是在啟動Rstudio時完成的）---[linux中我們在.bashrc文件中添加alias 作為快捷命令]

file.edit('~/.Rprofile') #首先用file.edit()來編輯文件
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對應(yīng)清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對應(yīng)中科大源
#保存重啟Rstudio
options()$repos
options()$BioC_mirror

2.安裝

install.packages(“包”)#安裝的包存在于CRAN網(wǎng)站
BiocManager::install(“包”)#安裝的包存在于Biocductor

3.加載

均可

library(包)
require(包)

安裝加載三部曲

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]

dplyr五個基礎(chǔ)函數(shù)

1.mutate()#新增列

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dplyr 兩個實用技能

1.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

（加載任意一個tidyverse包即可用管道符號）

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2：count統(tǒng)計某列的unique值

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dplyr處理關(guān)系數(shù)據(jù)

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1.內(nèi)連inner_join,取交集

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2.左連left_join

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3.全連full_join

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4.半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄semi_join

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5.反連接：返回?zé)o法與y表匹配的x表的所記錄anti_join

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6.簡單合并

在相當(dāng)于base包里的cbind()函數(shù)和rbind()函數(shù);注意，bind_rows()函數(shù)需要兩個表格列數(shù)相同，
bind_cols()函數(shù)需要兩個數(shù)據(jù)框有相同的行數(shù)

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