系列回顧：
1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理
要獲取我們需要的loom文件，你需要先安裝以下文件：
- 首先要求你的python >=3.6.0
- 安裝依賴軟件：
$ conda install numpy scipy cython numba matplotlib scikit-learn h5py click
當(dāng)然你也可以選擇用pip進(jìn)行安裝：
$ pip install numpy scipy cython numba matplotlib scikit-learn h5py click
- 安裝pysam
$ pip install pysam
- 安裝velocyto（這就是我們之后生成loom文件需要的軟件）
$ pip install velocyto
- 測(cè)試是否安裝成功：
$ velocyto --help
Usage: velocyto [OPTIONS] COMMAND [ARGS]...
Options:
--version Show the version and exit.
--help Show this message and exit.
Commands:
run Runs the velocity analysis outputting a loom file
run10x Runs the velocity analysis for a Chromium Sample
run_dropest Runs the velocity analysis on DropEst preprocessed data
run_smartseq2 Runs the velocity analysis on SmartSeq2 data (independent bam file per cell)
tools helper tools for velocyto
