生物學(xué)必知三大數(shù)據(jù)庫(kù)之一-NCBI
美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心

摘自：https://wenku.baidu.com/view/f86d817165ce0508763213df.html

它的使命包括四項(xiàng)任務(wù)：
1 建立關(guān)于分子生物學(xué)，生物化學(xué)，和遺傳學(xué)知識(shí)的存儲(chǔ)和分析的自動(dòng)系統(tǒng)
2 實(shí)行關(guān)于用于分析生物學(xué)重要分子和復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和功能的基于計(jì)算機(jī)的信息處理的，先進(jìn)方法的研究
3 加速生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件的使用
4 全世界范圍內(nèi)的生物技術(shù)信息收集的合作努力

1 Literature 文獻(xiàn)

• books（書庫(kù)）
  不斷收集生物醫(yī)學(xué)方面的書籍

• MeSH（醫(yī)學(xué)主題詞表）
  是NLM美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館為PubMed用于索引文章。

• NLM Catalog
  為藏書超過(guò)130萬(wàn)冊(cè)的美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生圖書館(NLM)記錄設(shè)立目錄信息，包括雜志、圖書、手稿、計(jì)算機(jī)軟件、錄音文件和其它電子資源。

• Pubmed
  一個(gè)免費(fèi)的搜尋引擎，提供生物醫(yī)學(xué)方面的論文搜尋以及摘要。

• Pubmed Central
  美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館目錄PubMed 公共醫(yī)學(xué)中心。

2 Genes（基因）

• ETS

  EST數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了GenBank EST中的所有數(shù)據(jù)和沒(méi)有生物學(xué)注釋信息的“單分子識(shí)別首次通過(guò)(first-pass single-read)”的cDNA序列。EST是從一個(gè)隨機(jī)選擇的cDNA 克隆進(jìn)行5’端和3’端單一次測(cè)序獲得的短的cDNA 部分序列，代表一個(gè)完整基因的一小部分，在數(shù)據(jù)庫(kù)中其長(zhǎng)度一般從20 到7000bp 不等，平均長(zhǎng)度為360 ±120bp。EST 來(lái)源于一定環(huán)境下一個(gè)組織總mRNA 所構(gòu)建的cDNA 文庫(kù)，因此EST也能說(shuō)明該組織中各基因的表達(dá)水平。

• Gene

  數(shù)據(jù)庫(kù)為用戶提供基因序列注釋和檢索服務(wù)，還會(huì)鏈接到NCBI的Map Viewer、Evidence Viewer、Model Maker、BLAST Link (Blink)、protein domains from the Conserved Domain Database(CDD)等數(shù)據(jù)庫(kù)資源以及其它與基因相基因Gene 關(guān)的資源。Entrez Gene數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了來(lái)自5300_多個(gè)物種的430萬(wàn)條基因記錄。

• GEO DataSets（基因表達(dá)文庫(kù)數(shù)據(jù)集）
  Gene Expression OmnibusDataSetsGEO DataSets 儲(chǔ)存由Gene Expression Omnibus (GEO) repository（資源庫(kù)）中得來(lái)的基因表達(dá)以及分子豐富性的數(shù)據(jù)。

• GEO profiles（基因表達(dá)文庫(kù)概況）
  數(shù)據(jù)庫(kù)(它負(fù)責(zé)收錄一個(gè)基因在一次試驗(yàn)中的定量基因表達(dá)數(shù)據(jù))

• HomoloGene
  是一個(gè)在20種完全測(cè)序的真核生物基因組中自動(dòng)檢索同源基因的系統(tǒng)，包括直系同源與旁系同源。HomoloGene的結(jié)果報(bào)告包括基因同源性和來(lái)自O(shè)MIM、小鼠基因組信息學(xué)(Mouse Genome Informatics, MGI)、斑馬魚信息網(wǎng)絡(luò)(Zebrafish Information Network, ZFIN)、酵母基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(Saccharomyces Genome Database, SGD)、直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups，COG)和果蠅數(shù)據(jù)庫(kù)(FlyBase)的基因表型信息。HomoloGene下載功能能下載HomoloGene中的轉(zhuǎn)錄體、蛋白質(zhì)和基因組序_列信息，還能下載基因組中特定基因的上游和下游序列。

• PopSet
  既包含核酸序列數(shù)據(jù)又包含蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)。

• unigene
  意為廣泛通用的基因數(shù)據(jù)庫(kù)，通過(guò)電腦對(duì)相同基因座（Locus）的收集整理集合形成一個(gè)非冗余的基因數(shù)據(jù)庫(kù)。

3 Health

• ClinVar
  整合這些分散的數(shù)據(jù)、將變異、臨床表型、實(shí)證數(shù)據(jù)以及功能注解與分析等四個(gè)方面的信息，通過(guò)專家評(píng)審，逐步形成一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的、可信的、穩(wěn)定的遺傳變異臨床表型相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)

• dbGaP（基因型和表型數(shù)據(jù)庫(kù)）
  歸檔、精選、發(fā)布由調(diào)查基因型和表型間相互作用的研究所產(chǎn)生的信息的數(shù)據(jù)分庫(kù)

• GTR（基因檢測(cè)注冊(cè)表）

• MedGen
  組織與人類醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)相關(guān)的信息

• OMIM（孟德?tīng)柸祟愡z傳病）
  持續(xù)更新關(guān)于人類基因和遺傳紊亂的數(shù)據(jù)庫(kù)