學習小組Day3-sansan

Conda安裝

以 miniconda 為例， 谷歌搜索 ”conda 清華“，復制最新的miniconda 鏈接
wget link
這是一個 xxx.sh 文件加載完成，類似安裝包。
bash miniconda-latest-xx.sh
最后一步，激活
source ~/.bashrc
安裝完成！

添加鏡像

# 使用中科大的鏡像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

conda 常用指令

conda list  #顯示所有的軟件
conda install fastqc=0.11.7  -y  # 安裝指定版本的fastqc，無需再詢問
conda create -n day3 python=3 fastqc abricate -y 創(chuàng)建名字為day3的環(huán)境，指定python版本是3，安裝fastqc 和abricate 兩個軟件，無需詢問。
conda activate/deactivate  day3

心得體會：以后我安裝軟件都要加上 -y

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