R包的學(xué)習(xí)

設(shè)置鏡像

在tools-options中是可以更改CRAN的鏡像的，但是沒法更改Bioconductor。（有時(shí)CRAN中沒有收錄的包可以在Bioconductor中嘗試下載）
在R的配置文件中進(jìn)行修改即可。

file.edit('~/.Rprofile')

然后再輸入

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對(duì)應(yīng)清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對(duì)應(yīng)中科大源

保存退出即可。

options()$repos      #查看CRAN的鏡像
options()$BioC_mirror   #查看Bioconductor的鏡像

安裝包

一般先嘗試在CRAN中下載包。

install.packages("包的名字")

如果沒有這個(gè)包可以嘗試在Bioconductor中下載。

BiocManager::install(“包”)

加載包

library(包)
require(包)

安裝好包之后一定要加載才可以使用。

以下以dplyr為例簡(jiǎn)單介紹R包

dplyr

出處：AI入門學(xué)習(xí)
dplyr包主要用于數(shù)據(jù)清洗和整理，主要功能有：行選擇、列選擇、統(tǒng)計(jì)匯總、窗口函數(shù)、數(shù)據(jù)框交集等,是非常高效、友好的數(shù)據(jù)處理包.

安裝、加載dplyr

install.packages("dplyr")
library(dplyr)

示例所用數(shù)據(jù)為內(nèi)置iris的簡(jiǎn)化版。

Iris數(shù)據(jù)集是常用的分類實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集，由Fisher, 1936收集整理。Iris也稱鳶尾花卉數(shù)據(jù)集，是一類多重變量分析的數(shù)據(jù)集。數(shù)據(jù)集包含150個(gè)數(shù)據(jù)樣本，分為3類，每類50個(gè)數(shù)據(jù)，每個(gè)數(shù)據(jù)包含4個(gè)屬性?？赏ㄟ^花萼長(zhǎng)度，花萼寬度，花瓣長(zhǎng)度，花瓣寬度4個(gè)屬性預(yù)測(cè)鳶尾花卉屬于（Setosa，Versicolour，Virginica）三個(gè)種類中的哪一類。

test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]

dplyr的5個(gè)基本函數(shù)

1.新增列，mutate()

增加一列，命名為new，輸出結(jié)果為Sepal.Length * Sepal.Width。

2.按列篩選，select()

選擇第二列，第1列和第3列，Petal.width這列。

3. 按行篩選，filter()

4.按列的數(shù)值大小排序，arrange()

5.匯總，summarise()