一、minicanda 的安裝

• 創(chuàng)建安裝目錄

  cd ~/biosoft
  

• 下載安裝腳本

  wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  

• 使配置文件生效

  source ~/.bashrc
  

• 命令行輸入 conda -v 看到有版本號(hào)輸出說(shuō)明成功了

  conda -V
  

二、minicanda 的軟件安裝與卸載

• 已安裝軟件目錄

  conda list
  

• 查找軟件

  conda search fastqc
  

• 軟件安裝

  conda install fastqc -y # 默認(rèn)最新版本
  conda install fastqc=0.11.7 -y # 指定版本
  

• 卸載軟件

  conda remove fastqc -y
  

三、minicanda 的環(huán)境配置

• 查看當(dāng)前conda環(huán)境

  conda info --envs
  

• 創(chuàng)建新的conda環(huán)境

  conda create -n rna-seq python=3 -y # 創(chuàng)建rna-seq的conda環(huán)境，python版本指定為3 -y:say yes in every step
  conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y # 創(chuàng)建環(huán)境的同時(shí)安裝軟件fastqc，trimmomatic
  

• 激活新的conda環(huán)境

  conda activate rna-seq
  

• 退出當(dāng)前conda環(huán)境

  conda deacivate
  

四、Typora工具

• 一個(gè)很好用的工具，可以用來(lái)打草稿，推薦Github格式，之后源碼模式粘貼到簡(jiǎn)書(shū)，markdown格式保留。