Data Cut Off

What?

Data Cut Off 數(shù)據(jù)截止,將數(shù)據(jù)鎖定在某個(gè)特定時(shí)間點(diǎn),之后的數(shù)據(jù)不納入分析。

Why?

在一些腫瘤試驗(yàn)或者其它長期試驗(yàn)中,研究過程中有該適應(yīng)癥的新藥上市,治療失敗或者疾病進(jìn)展的患者大概率會(huì)用新藥物治療,如果收集了這類數(shù)據(jù),那么就不能很好評(píng)價(jià)試驗(yàn)藥物的療效了。
這時(shí),如果設(shè)置恰當(dāng)?shù)腸utoff date,不納入后續(xù)數(shù)據(jù)分析,即可;
需要期中分析的試驗(yàn),試驗(yàn)過程中數(shù)據(jù)還是不斷收集,EDC系統(tǒng)不斷在錄入數(shù)據(jù),但是期中分析報(bào)告需要說明是什么節(jié)點(diǎn)的數(shù)據(jù)。這時(shí),也會(huì)需要date cutoff;
另外預(yù)設(shè)的某個(gè)milestone發(fā)生了,比如雙盲期療效數(shù)據(jù)收集完畢、需要進(jìn)行適應(yīng)性試驗(yàn)設(shè)計(jì)的樣本量重估、研發(fā)期間安全性更新報(bào)告(DSUR)更新等等。

How?

一般來說 有兩種cutoff方式:

  • 固定date的cutoff
    DSUR的更新
  • 按照訪視cutoff
    比如一項(xiàng)研究,雙盲期A、B藥分組服用,雙盲期結(jié)束后(揭盲)進(jìn)入開放期,出于倫理給患者服用療效更好的A藥,如果想要雙盲期的結(jié)果用于遞交,那么每個(gè)患者則按照訪視cutoff選則開放期開始前的所有訪視記錄。

按訪視cutoff與按date cutoff類似,以下以date cutoff為例說明。

一旦確定好DCO,PM會(huì)催促CRC盡快錄入截止日期前的數(shù)據(jù),DM會(huì)在DCO后的一段時(shí)間進(jìn)行數(shù)據(jù)清理,在這期間EDC系統(tǒng)仍然可能會(huì)錄入數(shù)據(jù),但是DM清理只集中在DCO之前的數(shù)據(jù),所有會(huì)存在DCO之后的臟數(shù)據(jù)。SAS programmer的工作流程:RAW?SDTM?ADaM,因此cutoff也有兩種方式:

  • 在SDTM進(jìn)行cutoff
  • SDTM保留原始數(shù)據(jù),在ADaM階段進(jìn)行cutoff

以上兩種方式均有利有弊。

支持1方式的觀點(diǎn):SDTM ADaM均是DCO數(shù)據(jù),提高了data traceability,而且這樣不會(huì)有DCO后的dirty data進(jìn)到SDTM。

支持2方式的觀點(diǎn):SDTM只作為原始數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化版本,不進(jìn)行數(shù)據(jù)的刪除。ADaM作為分析數(shù)據(jù)集可以進(jìn)行衍生、保留分析記錄等等操作的原則進(jìn)行cutoff。SDTM保留了所有原始數(shù)據(jù),避免信息丟失。

(以上觀點(diǎn)來自共事過的同事、領(lǐng)導(dǎo)、以及某行業(yè)會(huì)議上Victor(吳崇勝)的分享)

僅從sas編程的角度出發(fā),從SDTM進(jìn)行cutoff是更為簡單的。在ADaM階段進(jìn)行cutoff 可能會(huì)出現(xiàn),同一個(gè)信息在不同SDTM Domain出現(xiàn)需要多次cutoff的情況。比如死亡頁面,在DD domain需要DTHDTC,
DM domain也需要DTHDTC;比如不良事件,在AE domain記錄AETERM AESTDTC等,可能會(huì)在FA domain記錄該AE伴隨的一些其它特征,F(xiàn)AOBJ FADTC。個(gè)人更支持從SDTM就進(jìn)行cutoff。

具體的cutoff rules

基本的原則

對(duì)于日期完全缺失的記錄,無法判斷與DCO的前后關(guān)系,一般原則,是進(jìn)行保留,比如未知開始日期的AE,保守原則考慮會(huì)被納入TEAE進(jìn)行匯總分析。
對(duì)于部分缺失的日期,如果明確是在DCO之后的,不納入。否則保留。

DCO DTC include?
2024-09-15 2024-08 ?
2024-09-15 2024-09 ?
2024-09-15 2024-10 ?
具體規(guī)則
  • 按訪視收集的數(shù)據(jù)
    按檢查日期進(jìn)行cutoff
    milestone數(shù)據(jù):入組、隨機(jī)、知情同意、死亡等按相應(yīng)日期進(jìn)行cutoff
  • 不良事件、合并用藥數(shù)據(jù)
    存在開始日期和結(jié)束日期的數(shù)據(jù),不保留開始日期在DCO之后的記錄,如果結(jié)束日期在DCO之后,可將相應(yīng)的結(jié)束日期、轉(zhuǎn)歸等置空,另外若AE升級(jí)為SAE的日期在DCO之后,也可將其置空、AESER也置空等等;另外的做法是僅對(duì)開始日期在DCO之后的記錄剔除,結(jié)束日期等其它信息不做處理,進(jìn)行保留,這樣做保留了更多的信息,但對(duì)于這種做法,可能會(huì)保留未清理的數(shù)據(jù),(DM基于DCO清理數(shù)據(jù),對(duì)于這種DCO之后錄入的數(shù)據(jù)可能存在data issue)。
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