1900年，德國(guó)人在山東修膠濟(jì)鐵路，運(yùn)送山東的礦藏，同時(shí)借助當(dāng)?shù)毓俑?，殘害?dāng)?shù)匕傩?。義和團(tuán)運(yùn)動(dòng)提出“扶清滅洋”的口號(hào)，破壞鐵路，殺害德國(guó)人。慈禧對(duì)義和團(tuán)的政策搖擺不定，一方面想借助義和團(tuán)打擊洋人，另一方面又擔(dān)心義和團(tuán)坐大威脅清朝的統(tǒng)治。她派袁世凱接替毓賢，擔(dān)任山東巡撫，處理山東教案。
莫言的小說(shuō)《檀香刑》就以此為背景。在第十三章“破城”中，袁世凱給高密縣令發(fā)了一封電報(bào)，其中有這樣的話：
前次巨野教案，幾損我山東省大半主權(quán)，如此次人質(zhì)遇害，后患之巨難以設(shè)想。至?xí)r不惟國(guó)家將分疆裂土，吾等身家性命亦難保全。
巨野教案，又稱曹州教案。巨野就是古時(shí)的梁山泊。1894年，當(dāng)?shù)厝私M織“大刀會(huì)”，提出“興華滅洋，保衛(wèi)身家”的口號(hào)。
薛田資是德國(guó)傳教士，他是一名天主教圣言會(huì)會(huì)士，1893年，他來(lái)到中國(guó)，1895年初，擔(dān)任能方濟(jì)的助手。1896年秋，成為本堂神父，駐扎張家莊。直接上司是韓理加略。
能方濟(jì)在陽(yáng)谷傳教，韓理加略在鄆城傳教。1897年11月1日，二人赴兗州參加“諸圣瞻禮”，返程到張家莊教堂借宿。薛田資把自己的寢室讓給客人過(guò)夜，自己住進(jìn)院門耳房中。他們認(rèn)為這里很安全，沒(méi)有采取任何防范措施，薛田資也沒(méi)有鎖門。
晚上，下著小雨。十多人手持短刀，進(jìn)入張家莊教堂。兩名壯漢摸到薛田資的房間，破窗跳進(jìn)室內(nèi)，傳出幾聲槍響。能方濟(jì)和韓理加略身上有多處刺傷，在午夜前斃命。
因躲在耳房中逃過(guò)一劫的薛田資連夜偷偷跑到縣城告官，第二天逃往濟(jì)寧，電告德國(guó)駐華大使并轉(zhuǎn)德國(guó)政府。
知縣許廷瑞不敢怠慢，為了取得上司和德國(guó)人的寬恕，他在自己的轎桿上鎖上鏈子，摘去官帽以示有罪。他一面馬上到張家莊驗(yàn)尸，一面派軍隊(duì)保護(hù)教堂，并親自為教堂打更。
清廷擔(dān)心德國(guó)人以此為借口，生出事端。命山東巡撫李秉衡速派人馳往巨野破案，限15日內(nèi)將兇手捉拿歸案。
李秉衡派臬司毓賢和兗沂曹濟(jì)道巴岳特·錫良馳往查辦。普遍認(rèn)為，是“大刀會(huì)”制造了這場(chǎng)襲擊。他們?cè)诰抟按笏敛度?。?jù)薛田資記載，大約有50人被抓，其中一部分很快被釋放，一部分則被嚴(yán)刑拷打致死，還有的死于牢房里的傳染病。
其實(shí)，這些人都是冤枉的，他們受刑不過(guò)，屈打成招。如被判死刑的雷協(xié)身，其母親剛?cè)ナ?，重孝在身，無(wú)故被抓。還有被稱為“惠二啞巴”的惠潮，當(dāng)天正幫人蓋房，聽(tīng)說(shuō)母親被打，急忙跑去看，結(jié)果被抓，因口吃無(wú)法辯解，也被判了死刑。
據(jù)查，真正殺死兩位德國(guó)傳教士的，是劉德潤(rùn)、奚老五（奚際田）等人。劉潤(rùn)德是巨野縣獨(dú)山鎮(zhèn)小劉莊人，生于1845年，自幼習(xí)拳弄棒，練就一身好武功，人送外號(hào)“劉大刀”，他聯(lián)絡(luò)奚老五、奚效方、奚金蘭、曹言學(xué)等人，夜闖教堂，一則教訓(xùn)為非作歹的教主薛田資，二則警示逆來(lái)順受的清廷地方官員。事發(fā)第二天，劉潤(rùn)德攜妻女逃到梁山張博士集隱居，奚老五等十三人遠(yuǎn)走他鄉(xiāng)。
巨野教案給久欲占領(lǐng)中國(guó)領(lǐng)土的德國(guó)政府找到了借口。
11月7日，德皇威廉二世命令停泊在吳淞口的遠(yuǎn)東艦隊(duì)強(qiáng)行占領(lǐng)膠州灣。時(shí)任山東巡撫的李秉衡認(rèn)為“土地不可自我而失”，派兵相爭(zhēng)。德國(guó)遠(yuǎn)東艦隊(duì)司令蒂爾匹茨于11月14日命600名官兵突然登陸，搶占各山頭要隘，清軍退卻。之后，德駐華公使海靖奉命向清政府提出6項(xiàng)大大超出教案賠償?shù)臈l件的要求。雙方經(jīng)過(guò)一個(gè)多月的爭(zhēng)執(zhí)，于12月下旬達(dá)成了如下協(xié)議：
1、山東巡撫李秉衡革職，永不敘用；后刪去“永不敘用”，改為不能重用。李秉衡改任四川總督，因德國(guó)人不同意而作罷。八國(guó)聯(lián)軍攻打北京時(shí)，領(lǐng)兵出戰(zhàn)，在楊村兵潰，退至通州，吞金自盡。八國(guó)聯(lián)軍后來(lái)仍要求嚴(yán)懲，清政府只好下令追奪一切官職并撤銷恤典。
2、出白銀66000兩，在濟(jì)寧建天主教堂一座，匾額用“敕建天主堂”。
3、在曹州府城及巨野縣張家莊各建教堂一座，張家莊教堂后改在兗州建造。每座教堂中國(guó)撥地10畝，其余仿濟(jì)寧教堂辦法。
4、賠償?shù)聡?guó)教士損失白銀3000兩。
5、發(fā)布諭旨，飭地方官照約教堂教士，曹州府等處未能用力保護(hù)德國(guó)教士之地方官六員調(diào)赴他省。
6、自膠澳（膠州灣）造鐵路至濟(jì)南省城。
1898年3月6日，由李鴻章、翁同龢代表滿清政府，在北京與德國(guó)駐中國(guó)公使海靖簽署《中德膠澳租界條約》。條約內(nèi)容包括租借膠澳地區(qū)、修筑膠濟(jì)鐵路及開(kāi)發(fā)沿線礦藏，和山東省事務(wù)共三端十款。
此后，膠澳地區(qū)成為德國(guó)的租借地，并開(kāi)始了以青島為中心的城市建設(shè)，山東變成德國(guó)的勢(shì)力范圍。其他列強(qiáng)（俄羅斯，英國(guó)，法國(guó)和日本）紛紛仿效德國(guó)，爭(zhēng)奪殖民地，以此確保自己在中國(guó)的勢(shì)力。
一戰(zhàn)后，該條約被二十一條取代。
