fst計(jì)算

FST分析

首先將plink文件轉(zhuǎn)化成VCF文件（轉(zhuǎn)換方法見plink章）
準(zhǔn)備兩個(gè)種群文件sample1andsample2

sample1代表一個(gè)群體ID

xi1
XI2
xi3

sample2代表一個(gè)群體的ID。

qi1
qi2
qi3
qi4

用vcftools進(jìn)行fst分析:test.vcf為輸入文件。

vcftools --vcf test.vcf –weir-fst-pop sample.txt –weir-fst-pop sample2.txt –out outfile
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