Chen XP, Long X, Jia WL, et al. Viral integration drivesmultifocal HCC during the occult HBV infection. Journal of experimental & clinical cancer research
CR. 2019;38(1):261
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背景
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標本類型及來源
本研究中OBI患者的肝臟具有血管轉(zhuǎn)移性侵襲和多個腫瘤的表征。
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10個手術(shù)標本：
（1）6個腫瘤：從最大的腫瘤部位獲得的T1，在右肝葉中發(fā)現(xiàn)的3個較小的肝腫瘤（T2-T4），以及栓塞HCC在肝靜脈和門靜脈中的轉(zhuǎn)移沉積（HVTT和PVTT）。
（2）4個對照：來自相鄰非腫瘤肝組織（N1-N4）
生信部分
通過病毒體捕獲測序（VCS）鑒定具有整合的HBV-B2 DNA的所有樣品。
尋找HBV整合和病毒重排。
單細胞VCS數(shù)據(jù)識別腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性。
通過全基因組測序（WGS）揭示腫瘤內(nèi)HBV整合位點的常見“局部單倍型”。
常見全基因組體細胞改變揭示了多灶性HCC的單克隆起源。
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驗證部分
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