生信分析 公共數(shù)據(jù)庫 SRR 數(shù)據(jù)下載

第一種,在EBI 查找,
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home 常規(guī)轉(zhuǎn)錄組可能直接找到下載R1,R2

網(wǎng)站信息,復(fù)制R1R2的鏈接即可下載

第二種,從NCBI的ftp服務(wù)器直接下載,

ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/srr/ 如果下載SRR數(shù)據(jù),可以在這里獲取直接連接,根據(jù)SRR號的前三位,后三位/后兩位定位數(shù)據(jù)。速度還行,多線程速度感人。

對應(yīng)項目的SRR號

FTP 服務(wù)器信息
根據(jù)SRR號前三位,后三位/兩位數(shù)值查找
復(fù)制對應(yīng)文件地址
下載文件可能需要改名為SRA拆分
多線程下載速度感人

第三種,從對應(yīng)樣本的目錄下直接下載

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