如何在linux中安裝軟件
1. 什么是conda?
Conda 是一個開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng)，用于安裝多個版本的軟件包及其依賴關(guān)系，并在它們之間輕松切換。
Conda 是為Python程序創(chuàng)建的，適用于 Linux，OS X 和Windows，也可以打包和分發(fā)其他軟件。
2. 下載conda（miniconda是conda的精華版）
- 百度/谷歌搜索“miniconda 清華”（是清華的conda鏡像網(wǎng)站）
- 找到與服務(wù)器匹配的版本（要先用uname -a 命令查看服務(wù)器是多少位的）
- 復(fù)制下載鏈接
登錄服務(wù)器，用 wget 命令 + 下載鏈接（這里不僅要粘上下載鏈接，還有路徑也要有的，否則就像下圖）
錯誤的.png
這樣才是正確的下載成功界面
正確的.png
3. 安裝miniconda
用 bash 命令進(jìn)行安裝 ，即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
image.png
根據(jù)提示進(jìn)行，每一步操作，要繼續(xù)按enter鍵，或yes或no
安裝成功.png
4. 激活conda
用source ~/.bashrc 來激活
然后命令行輸入conda，出現(xiàn)滿屏的信息說明成功了
激活成功.png
5. 開始使用conda
- 查看當(dāng)前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表
conda list - 搜索conda軟件
conda search fastqc
鏡像未配置好，出現(xiàn)失敗
搜索失敗.png
重新配置鏡像，在進(jìn)行搜索就可以了
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
全選復(fù)制粘貼回車
重新配置鏡像后成功搜索.png
安裝軟件
conda install fastqc -y卸載軟件
conda remove fastqc -y
