有很多醫(yī)學(xué)研究生或者臨床醫(yī)生說(shuō)不會(huì)選題，今天來(lái)分享一下如何利用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行選題，參考文章：Elevated TEFM expression promotes growth and metastasis through activation of ROS/ERK signaling in hepatocellular carcinoma，這篇文章發(fā)表在Cell Death & Disease上，影響因子：6.3，中科院最新分區(qū)：二區(qū)，屬于OA期刊，需要收取版面費(fèi)，不在中科院發(fā)布的國(guó)際預(yù)警期刊名單上。

1、選題選題，也就是我們尋找一個(gè)沒(méi)有人做過(guò)類(lèi)似研究?jī)?nèi)容的基因。按照參考范文的思路，我們可以下載TCGA數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析，生存分析，發(fā)現(xiàn)這個(gè)基因在肝癌中表達(dá)上調(diào)或者下調(diào)，并且對(duì)預(yù)后有影響的，然后查閱文獻(xiàn)看看沒(méi)有人做過(guò)，如果沒(méi)有人做過(guò)的話(huà)就可以作為候選基因開(kāi)展后續(xù)工作。

2、我們僅用TCGA數(shù)據(jù)分析不一定是可靠的，所以需要自己收集臨床樣本進(jìn)行表達(dá)量的驗(yàn)證，組織的表達(dá)、細(xì)胞系的表達(dá)、蛋白表達(dá)水平這些驗(yàn)證都跟TCGA數(shù)據(jù)分析一致的話(huà)，就可以開(kāi)展后面細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)。

3、探索這個(gè)基因?qū)Ω伟┘?xì)胞的增殖、轉(zhuǎn)移的影響。

3、做完了細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)，就要探索這個(gè)基因的上下游調(diào)控機(jī)制（受那一條miRNA調(diào)控、激活那一條信號(hào)通路發(fā)揮作用），當(dāng)然，如果經(jīng)費(fèi)不足就沒(méi)有辦法開(kāi)展下去。

總結(jié)：

除了使用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)選題，我們也可以使用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行選題，特別是非腫瘤方向。我們根據(jù)數(shù)據(jù)挖掘的方法選出的候選基因不一定能夠在實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證或者理想的預(yù)期結(jié)果，也有可能導(dǎo)致后續(xù)工作無(wú)法開(kāi)展，從而發(fā)不了文章。因?yàn)榭蒲卸际谴嬖谝欢L(fēng)險(xiǎn)的，而且風(fēng)險(xiǎn)的高低往往跟你文章的高度成正比。你的論證思路復(fù)雜，實(shí)驗(yàn)操作難度大，花的經(jīng)費(fèi)就多了，風(fēng)險(xiǎn)也高了，發(fā)文章的分?jǐn)?shù)自然而然就高；你的論證思路簡(jiǎn)單，內(nèi)容分析少，花的經(jīng)費(fèi)就少了，風(fēng)險(xiǎn)也低，文章的分?jǐn)?shù)就高不了。