一、韋恩圖

恩圖一般指維恩圖。維恩圖（英語：Venn diagram），或譯Venn圖、文氏圖、溫氏圖、韋恩圖，是在所謂的集合論（或者類的理論）數(shù)學(xué)分支中，在不太嚴(yán)格的意義下用以表示集合（或類）的一種草圖。

在轉(zhuǎn)錄組分析中，常常用韋恩圖來表示各組之間差異表達(dá)基因數(shù)量的關(guān)系。

二、代碼實現(xiàn)

python畫圖我們首先想到的是matplotlib庫，強大的畫圖庫。
然而，matplotlib庫本身并不能繪制VENN圖，需要借助第三方庫matplotlib_venn，當(dāng)然matplotlib_venn庫也是依賴matplotlib庫的。
下面，我們將分別利用matplotlib_venn庫的venn2和venn3函數(shù)來繪制兩組數(shù)據(jù)和三組數(shù)據(jù)的Venn圖。

venn2

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib_venn import venn2
venn2(
    subsets = [set([1,2,3]),set([42,3,4,5])],
    set_labels=('A','B'),
    set_colors=('r','g'))

image

1. subsets：必須的參數(shù)，即繪圖所需的數(shù)據(jù)集，subsets接受三種格式的輸入數(shù)據(jù)：
   1.1 一個list，包含兩個set元素，set中包含兩個數(shù)據(jù)集集體的數(shù)據(jù)，即上述代碼使用的方法；
   1.2 一個三個key字典，key是兩個字符的二進(jìn)制編碼方式，所以三個key必須是“10”，“01”和“11”，value分別代表對應(yīng)區(qū)域的大小，{'10': 2, '01': 3, '11': 1}
   1.3 一個包含三個數(shù)字的list，三個數(shù)字分別代表圖形三部分的大小，[2,3,1]
2. set_labels：設(shè)置數(shù)據(jù)的標(biāo)簽，即圖形中兩組數(shù)據(jù)的名稱
3. set_colors：設(shè)置圖形的顏色

venn3

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib_venn import venn3
my_dpi=100
plt.figure(figsize=(800/my_dpi, 600/my_dpi), dpi=my_dpi)#控制圖尺寸的同時，使圖高分辨率（高清）顯示
venn3(
    subsets = [set([1,2,3,5,9]),set([1,2,4,6]),set([1,3,4,7])],
    set_labels=('A','B','C'),
    set_colors=('r','g','b')
)
plt.savefig('./test.jpg')
plt.show()

image

1. 科研作圖對分辨率有要求，可通過plt.figure()進(jìn)行調(diào)整，圖像的大小和dpi。
2. 注意，圖片的保存plt.savefig()一定要放在plt.show()之前，不然保存的就是一張空白圖片。

matplotlib_venn庫只能實現(xiàn)兩組或者三組數(shù)據(jù)的韋恩圖的繪制，更多數(shù)據(jù)集暫時不支持。(哭笑.jpg)

參考資料

維恩圖_百度百科 (baidu.com)