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序號：2020-132

編者按：

PolyloxExpress條形碼為研究造血干細胞的命運決定機制提供了新的方向和研究手段，并有望被廣泛用于其他領域的細胞命運和譜系研究。

通過PolyloxExpress條形碼解析造血干細胞克隆的命運和單細胞轉(zhuǎn)錄組學

【文獻類別】技術方法-譜系追蹤

【發(fā)表期刊】Cell Stem Cell

【影響因子】 20.9

【發(fā)表時間】2020-08-05

【PMID】32783885

【文章摘要】譜系追蹤揭示了造血干細胞（HSC）的命運，而單細胞RNA測序只能識別HSC轉(zhuǎn)錄組的快照。為了在同一細胞中獲得關于命運和轉(zhuǎn)錄組信息，研究人員開發(fā)了PolyloxExpress等位基因，可實現(xiàn)依靠Cre重組酶進行的RNA原位編碼。將細胞命運與單個HSC轉(zhuǎn)錄組聯(lián)系起來可提供鑒定HSC命運的轉(zhuǎn)錄組特征所需的信息，而這在單獨的單個HSC轉(zhuǎn)錄組中并不明顯。研究人員發(fā)現(xiàn)分化不活躍，多譜系和譜系限制的HSC克隆各處于造血過程的轉(zhuǎn)錄圖譜的不同區(qū)域。他們還發(fā)現(xiàn)分化不活躍的HSC克隆更接近于轉(zhuǎn)錄軌跡的起始點，但并沒有以靜態(tài)基因標簽為特征。命運特定的基因標簽暗示了HSC克隆細胞命運的一致性，并且向短壽命譜系組細胞輸出的HSC表明，HSC命運隨著時間的推移是穩(wěn)定的。這些在生理條件下對細胞命運和轉(zhuǎn)錄組的綜合分析將為鑒定HSC細胞命運決定背后的分子機制鋪平道路。

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