生信SCI2-3分怎么發(fā),非腫瘤類生信發(fā)文套路
文章一:Gene expression profiling predicts pathways and genes associated with Parkinson’s disease
2015年從GEO下載一套PD數(shù)據(jù),進(jìn)行差異基因分析與驗(yàn)證,再通過通路以及GO分析與PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建進(jìn)行書寫。討論部分可以借鑒作者的寫法(經(jīng)典的總分總),揭示PD診療可能存在的靶基因與通路。
文章2 ScRNA seq analysis reveals mitochondrial dynamics in oocytes of patients with polycystic ovary syndrome
三分生信套路2020.3月底,可以重點(diǎn)借鑒。(單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序+WGCNA)做純生信分析,發(fā)現(xiàn)多能卵巢綜合征的線粒體新功能。
借鑒點(diǎn):
1文章示意圖以及流程圖的擺放非常漂亮可以借鑒
[if !supportLists]2.?[endif]Introduction寫法第一段:(先介紹流行病學(xué)+臨床表現(xiàn)),but機(jī)制上存在未知。(目前療法+but治療缺陷)第二段:研究對(duì)象B作用是什么,與表型有什么相關(guān)作用,機(jī)制上目前未知...。第三段:在本文中,作者分析了什么數(shù)據(jù),通過結(jié)合什么,作者確定了PCOS線粒體動(dòng)力學(xué)與線粒體功能與卵巢細(xì)胞的功能相關(guān)。
[if !supportLists]3.?[endif]文章擺圖借鑒:Fig1:流程圖示意 ?Table1:臨床數(shù)據(jù)為方便WGCNA關(guān)聯(lián),關(guān)聯(lián)方式可以與外在性狀關(guān)聯(lián),也可與疾病發(fā)展階段關(guān)聯(lián)。與疾病形狀關(guān)聯(lián)可能會(huì)存在p值較大不好顯示差異的情況。 Fig2通過Metasscape對(duì)不同模塊進(jìn)行聚集分析,再利用GSEA分析發(fā)現(xiàn)氧化磷酸化通路顯著,于是將通路富集到線粒體上。 Fig3 上述完成不同時(shí)期WGCNA分析之后,作者又對(duì)每個(gè)時(shí)期正常女性與多能卵巢女性差異進(jìn)行分析(按照疾病的三個(gè)階段,進(jìn)行差異分析,通過Veen圖找出共有以及獨(dú)特的差異)Fig4:對(duì)于生物過程,作者對(duì)得出的差異進(jìn)行富集分析(整體分析套路都是找到差異模塊,再進(jìn)行富集分析)。Fig5:找到顯著差異的9個(gè)與線粒體相關(guān)基因,展示其不同狀況階段的表達(dá)量 Fig6:在KEGG上畫一個(gè)很秀的圖值得借鑒。
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