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引出問(wèn)題
在處理whole slide images時(shí)，出現(xiàn)Slide/Mask dimension does not match , X_slide / X_mask : 98304 / 1536, Y_slide / Y_mask : 103936 / 2048的問(wèn)題。
問(wèn)題原因
openslide版本問(wèn)題，在openslide==3.4.1中更新了這個(gè)問(wèn)題，所以要安裝openslide==3.4.1。最想吐槽的是，尼瑪啊，camelyon比賽官方評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)代碼中用 倍數(shù)關(guān)系控制whole slide image多分辨率問(wèn)題，但是openslide==3.4.1之前的版本不適用這個(gè)倍數(shù)關(guān)系，這才導(dǎo)致多分辨率下長(zhǎng)寬倍數(shù)關(guān)系不一致，我覺(jué)得很LOW！
解決方法
大體分為這6個(gè)步驟：
- 查看openslide版本
- 卸載openslide
- 安裝openslide==3.4.1依賴(lài)項(xiàng)
- 安裝openslide==3.4.1
- 查看安裝是否成功
- 安裝openslide-python
查看openslide版本：通過(guò)openslide-show-properties --version查看目前安裝的版本，如果不是3.4.1版本，請(qǐng)接著往下看，如果是，就退出本頁(yè)面就OK了。
卸載openslide:通過(guò)sudo apt-get purge --auto-remove python-openslide連帶其依賴(lài)項(xiàng)完全卸載干凈，以及刪除相應(yīng)的文件，麻煩確保使用該命令刪除干凈，不然你會(huì)安裝兩個(gè)版本的openslide, 那等下安裝openslide-python，它會(huì)依賴(lài)調(diào)用那個(gè)版本的openslide只能聽(tīng)天由命了?。∵@時(shí)候，你可以通過(guò)查看版本，來(lái)查看openslide有沒(méi)有卸載完成，如果沒(méi)有，請(qǐng)想別的辦法，卸載之后再繼續(xù)...
安裝openslide==3.4.1:
首先進(jìn)入openslide官網(wǎng) 下載源文件
-
解壓文件，編譯
cd openslide-3.4.1 ./configure make sudo make install #### 到上面基本安裝完成，如在./configure報(bào)錯(cuò)，可能就是缺少依賴(lài)項(xiàng)，請(qǐng)使用： sudo apt-get install * 來(lái)安裝依賴(lài)項(xiàng)，在進(jìn)行./configure。。。
查看安裝是否完成：openslide-show-properties --version看一下版本
安裝openslide-python:pip install openslide-python
后記
有什么問(wèn)題歡迎留言！
